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动植物无参考基因组遗传谱图的构建
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| 请教一下做GWAS，遗传进化的同学们，如果做了一批植物的上百个样本的全基因组测序，但是这个植物的参考基因组只组装到了scaffold水平，想构建遗传图谱的话，怎样进行操作呢。首先需要组装，然后call SNP，然后得到的vcf文件有很多scaffold，怎样进行cluster 得到主要的连锁图谱呢？ |
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