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small28

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各位,我的多肽样品在做maldi tof时,为啥一级谱出现的主要峰数据都差不多呢,尽管它们是在hplc上相隔很远的保留时间接下来的。。。
于是,想去做个lc ms。那么lc ms也是要先做一级吗,,能不能直接做二级,这样的话,假如样品复杂的话峰数据会不会很乱,因为听说lc ms上一个hplc峰对应一张图?如果先做一级,那母离子怎么选呢,会不会多种物质的母离子峰在一张图里面呢。。。

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proteomicszj

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蛋白的LC-MS/MS鉴定已经非常程序化了。一次LC-MS/MS, 一小时液相梯度内可以鉴定样品中多达4000多种蛋白质。大部分情况下一张MS/MS质谱图来主要自一个母离子。
57楼2019-08-24 09:56:47
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引用回帖:
57楼: Originally posted by proteomicszj at 2019-08-24 09:56:47
蛋白的LC-MS/MS鉴定已经非常程序化了。一次LC-MS/MS, 一小时液相梯度内可以鉴定样品中多达4000多种蛋白质。大部分情况下一张MS/MS质谱图来主要自一个母离子。

如果不做一级直接做二级,仪器会自动选母离子打碎继续做二级么

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58楼2019-08-24 10:42:30
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proteomicszj

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58楼: Originally posted by small28 at 2019-08-24 10:42:30
如果不做一级直接做二级,仪器会自动选母离子打碎继续做二级么
...

没有一级质谱,怎么筛选母离子?成本是一样的,不要考虑价格。
64楼2019-08-24 12:29:58
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引用回帖:
64楼: Originally posted by proteomicszj at 2019-08-24 12:29:58
没有一级质谱,怎么筛选母离子?成本是一样的,不要考虑价格。...

那就是还是要先做一级质谱么,如果一个hplc峰里包含了两三种物质,那一级谱上会不会有多个母离子呀,那又怎么选呢

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65楼2019-08-24 12:53:36
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proteomicszj

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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
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65楼: Originally posted by small28 at 2019-08-24 12:53:36
那就是还是要先做一级质谱么,如果一个hplc峰里包含了两三种物质,那一级谱上会不会有多个母离子呀,那又怎么选呢
...

根据母离子信号强度,随机、不重复分析,一次上机可以依次分析一个HPLC峰上几百个母离子。
67楼2019-08-24 14:47:52
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small28

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67楼: Originally posted by proteomicszj at 2019-08-24 14:47:52
根据母离子信号强度,随机、不重复分析,一次上机可以依次分析一个HPLC峰上几百个母离子。...

那这个母离子的判断是人工选的,还是仪器软件自带识别的呢

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68楼2019-08-24 15:02:43
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68楼: Originally posted by small28 at 2019-08-24 15:02:43
那这个母离子的判断是人工选的,还是仪器软件自带识别的呢
...

机器根据信号强度随机选择母离子
76楼2019-08-24 23:25:28
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76楼: Originally posted by proteomicszj at 2019-08-24 23:25:28
机器根据信号强度随机选择母离子...

好的,谢谢,还想请教一下,在hplc峰上不同保留时间的峰打出得一级谱,为啥信号都很相似呢,就是信号强的数据一样,,这是说明,不同holc的峰,物质特性类似吗?

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81楼2019-08-25 14:16:33
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81楼: Originally posted by small28 at 2019-08-25 14:16:33
好的,谢谢,还想请教一下,在hplc峰上不同保留时间的峰打出得一级谱,为啥信号都很相似呢,就是信号强的数据一样,,这是说明,不同holc的峰,物质特性类似吗?
...

一般不一样,除非相邻比较近,或者很强的杂质污染。
88楼2019-08-25 21:37:17
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88楼: Originally posted by proteomicszj at 2019-08-25 21:37:17
一般不一样,除非相邻比较近,或者很强的杂质污染。...

好的,谢谢,您是指样品存在杂质污染还是仪器呢,样品分别是在自己的hplc上接的峰,然后纯度检测跑出单峰后,再冻干送样的

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89楼2019-08-25 21:46:31
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89楼: Originally posted by small28 at 2019-08-25 21:46:31
好的,谢谢,您是指样品存在杂质污染还是仪器呢,样品分别是在自己的hplc上接的峰,然后纯度检测跑出单峰后,再冻干送样的
...

一般是样品问题。LC-MS/MS分析一下,MALDI-TOF测多肽的灵敏度差多了。
92楼2019-08-26 20:49:59
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92楼: Originally posted by proteomicszj at 2019-08-26 20:49:59
一般是样品问题。LC-MS/MS分析一下,MALDI-TOF测多肽的灵敏度差多了。...

好的,谢谢你!

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93楼2019-08-26 20:54:26
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[考研] 求材料调剂 +4 berdmond 2026-03-05 4/200 2026-03-05 19:45 by 黑衣馒头人
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[考研] 0856材料专硕274能调剂去哪里? +3 22735 2026-03-04 4/200 2026-03-05 09:06 by 斩魂滴兔子!
[考研] 307求调剂 +4 xuyuan111 2026-03-04 5/250 2026-03-04 20:39 by kakakapanpan
[考研] 一志愿314求调剂 +7 202111120625 2026-03-03 7/350 2026-03-04 15:56 by zhukairuo
[考研] 化工专硕调剂 +4 利好利好. 2026-03-03 7/350 2026-03-03 21:30 by L135790
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