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zjj_0512

铁虫 (小有名气)

[求助] autodock使用问题求助 已有3人参与

求助啊,我用Autodock 做分子对接,按教程上的来,前面的感觉都没啥问题,一到docking这一步要把大分子蛋白放进去,点set rigid filename然后选择我的pdbqt文件,确定后就没有任何反应,配体小分子能导进去,就是大分子导不进去是怎么 回事,试了好几遍都不行,不知道哪里出了问题,急求啊
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南中医赵四

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by longdlut at 2019-08-21 16:50:58
盒子位置大小要参考文献来

girdbox参数怎么找啊   我找了好多文献都没找到感觉像涝针

发自小木虫Android客户端
8楼2019-08-25 12:00:05
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longdlut

捐助贵宾 (著名写手)


2楼2019-08-21 12:00:35
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therotyonth

金虫 (正式写手)

刚性蛋白导入确实不会显示,这一步主要是告诉程序使用的蛋白pdbqt文件和条用grid生成的map文件。

发自小木虫Android客户端
3楼2019-08-21 14:33:20
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zjj_0512

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by therotyonth at 2019-08-21 14:33:20
刚性蛋白导入确实不会显示,这一步主要是告诉程序使用的蛋白pdbqt文件和条用grid生成的map文件。

那我就没管继续了下一步,然后再操作完成后,到最后运行了autodock,很快就结束了正常么?然后生成了一个dlg文件,我用analyze打开就提示错误AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol',这个是什么意思呢?没有对接成功么?应该怎么调整呢?
4楼2019-08-21 14:45:00
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