应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » autodock使用问题求助
51/1返回列表
查看: 2515  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zjj_0512

铁虫 (小有名气)

[求助] autodock使用问题求助 已有3人参与

求助啊，我用Autodock 做分子对接，按教程上的来，前面的感觉都没啥问题，一到docking这一步要把大分子蛋白放进去，点set rigid filename然后选择我的pdbqt文件，确定后就没有任何反应，配体小分子能导进去，就是大分子导不进去是怎么 回事，试了好几遍都不行，不知道哪里出了问题，急求啊
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2019-08-21 10:44:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

南中医赵四

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by longdlut at 2019-08-21 16:50:58
盒子位置大小要参考文献来

girdbox参数怎么找啊   我找了好多文献都没找到感觉像涝针

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
8楼2019-08-25 12:00:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

longdlut

捐助贵宾 (著名写手)
继续向xiabu

发自小木虫Android客户端
回复此楼
2楼2019-08-21 12:00:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

therotyonth

金虫 (正式写手)
刚性蛋白导入确实不会显示，这一步主要是告诉程序使用的蛋白pdbqt文件和条用grid生成的map文件。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2019-08-21 14:33:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zjj_0512

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by therotyonth at 2019-08-21 14:33:20
刚性蛋白导入确实不会显示，这一步主要是告诉程序使用的蛋白pdbqt文件和条用grid生成的map文件。

那我就没管继续了下一步，然后再操作完成后，到最后运行了autodock，很快就结束了正常么？然后生成了一个dlg文件，我用analyze打开就提示错误AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'，这个是什么意思呢？没有对接成功么？应该怎么调整呢？
赞一下 回复此楼
4楼2019-08-21 14:45:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 0307化学求调剂 +3 0ok0k 2026-03-07 3/150 2026-03-07 10:48 by 球场大飞机
[考研] 一志愿211，0860总分286食品工程专业求调剂 +6 林林Winnie 2026-03-05 6/300 2026-03-06 20:06 by 我想上研究生.
[考研] 324求调剂 +5 wxz2 2026-03-03 8/400 2026-03-06 17:04 by 情长不过时光
[考研] 085600材料调剂 总分330 +6 池池丶 2026-03-03 6/300 2026-03-06 15:50 by @飒飒飒飒
[考研] 求调剂，学校研究所都可以，材料与化工267分 +6 wmx1 2026-03-05 6/300 2026-03-05 20:01 by houyaoxu
[考研] 一志愿武理085601专硕347分求调剂 +4 啊欧欧欧 2026-03-04 5/250 2026-03-05 19:27 by Leding1356
[考研] 301求调剂 +4 李LJR 2026-03-04 4/200 2026-03-05 13:31 by Iveryant
[考研] 283求调剂 +10 鹿沫笙 2026-03-02 11/550 2026-03-05 13:12 by ZHANGTDK
[考研] 化学 0703求调剂 总分293 一志愿211 +9 土土小虫 2026-03-03 11/550 2026-03-05 09:26 by vfdbghn
[考研] 266求调剂 +7 哇塞王帅 2026-03-03 7/350 2026-03-04 20:30 by 一切OK
[考研] 085600 材料与化工 298 +14 小西笑嘻嘻 2026-03-03 14/700 2026-03-04 16:23 by sslc1985
[考研] 武理材料工程302调剂 +3 Doleres 2026-03-03 6/300 2026-03-04 15:54 by zhukairuo
[考研] 264求调剂 +3 thext 2026-03-03 3/150 2026-03-04 09:29 by 热情沙漠
[考研] 材料工程专硕283求调剂 5+8 ，！？ 2026-03-02 10/500 2026-03-03 12:01 by EBSD
[考研] 材料工程求调剂 +3 1431251 2026-03-03 3/150 2026-03-03 11:58 by EBSD
[考研] 0856材料调剂 +5 沿岸有贝壳OUC 2026-03-02 5/250 2026-03-02 20:31 by hypershenger
[考研] 284求调剂 +10 天下熯 2026-02-28 11/550 2026-03-02 11:03 by 无际的草原
[考研] 272求调剂 +6 田智友 2026-02-28 6/300 2026-03-01 21:40 by 公瑾逍遥
[考研] 328求调剂 +3 aaadim 2026-03-01 5/250 2026-03-01 17:29 by njzyff
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭