应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » autodock使用问题求助
51/1返回列表
查看: 2534  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zjj_0512

铁虫 (小有名气)

[求助] autodock使用问题求助 已有3人参与

求助啊，我用Autodock 做分子对接，按教程上的来，前面的感觉都没啥问题，一到docking这一步要把大分子蛋白放进去，点set rigid filename然后选择我的pdbqt文件，确定后就没有任何反应，配体小分子能导进去，就是大分子导不进去是怎么 回事，试了好几遍都不行，不知道哪里出了问题，急求啊
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2019-08-21 10:44:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zjj_0512

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by longdlut at 2019-08-21 12:00:35
继续向xiabu

在Grid这一步中两个分子都导入后是放在一起的才对么？？我个导进来两个东西就离得很远是单独开来的，我在想是不是这出了问题
赞一下 回复此楼
6楼2019-08-21 15:05:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

longdlut

捐助贵宾 (著名写手)
继续向xiabu

发自小木虫Android客户端
回复此楼
2楼2019-08-21 12:00:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

therotyonth

金虫 (正式写手)
刚性蛋白导入确实不会显示，这一步主要是告诉程序使用的蛋白pdbqt文件和条用grid生成的map文件。

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
3楼2019-08-21 14:33:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zjj_0512

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by therotyonth at 2019-08-21 14:33:20
刚性蛋白导入确实不会显示，这一步主要是告诉程序使用的蛋白pdbqt文件和条用grid生成的map文件。

那我就没管继续了下一步，然后再操作完成后，到最后运行了autodock，很快就结束了正常么？然后生成了一个dlg文件，我用analyze打开就提示错误AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'，这个是什么意思呢？没有对接成功么？应该怎么调整呢？
赞一下 回复此楼
4楼2019-08-21 14:45:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 hf7uyzp320 2026-03-10 6/300 2026-03-11 11:01 by 5vkk2l1t47
[考研] 0857 资源与环境 285分 +5 未名考生 2026-03-09 5/250 2026-03-11 10:20 by 沙漠之狐994
[考研] 材料工程307，求调剂 +7 我要燃烧你的梦 2026-03-08 7/350 2026-03-11 09:09 by 剑诗杜康
[考研] 工科0856专硕化学工程269能调剂吗 +6 我想读研11 2026-03-10 6/300 2026-03-11 08:48 by brilliant
[基金申请] 提交后的基金本子，已让学校撤回了，可否换口子提交 +3 dut_pfx 2026-03-10 3/150 2026-03-11 08:38 by kudofaye
[考研] 求调剂材料专硕293 +6 段_(:з」∠)_ 2026-03-10 6/300 2026-03-10 18:22 by ms629
[考博] 读博申请 +4 感dd 2026-03-10 6/300 2026-03-10 17:01 by nxgogo
[考研] A区一本交叉课题组，低分调剂，招收机械电子信息通信等交叉方向 +56 lisimayy 2026-03-04 73/3650 2026-03-10 15:27 by lisimayy
[考研] 一志愿清华深研院材料专硕294分，专业课111分，本科中南大学材料，有六级，有工作经验 +4 H14528 2026-03-04 4/200 2026-03-10 11:03 by dj19940201
[考研] 环境调剂 +5 晓看天暮看云 2026-03-09 5/250 2026-03-10 10:46 by 星空星月
[考研] 数二英二309分请求调剂 +3 dtdxzxx 2026-03-09 4/200 2026-03-09 19:56 by yuningshan
[考研] 考研调剂，一志愿山东大学材料与化工，328分，政治51 +5 关你西红柿929 2026-03-08 6/300 2026-03-09 13:50 by 新篇章DFSS
[考研] 0703化学求调剂 +4 很老实人 2026-03-09 4/200 2026-03-09 13:38 by macy2011
[考研] 一志愿武汉理工085601，初试301分，请问能调剂到湖北吗 +3 肖yang 2026-03-06 3/150 2026-03-07 19:08 by ms629
[考研] 复试调剂 +7 呼呼？~+123456 2026-03-05 10/500 2026-03-06 16:07 by @飒飒飒飒
[考研] 085602高分子方向求调剂 +7 tlgudy 2026-03-04 7/350 2026-03-06 14:17 by guosr9609
[考研] 求调剂 +5 danyyyy 2026-03-04 5/250 2026-03-06 08:16 by Leeding1356
[考研] 282求调剂 +7 夕～日 2026-03-05 8/400 2026-03-05 21:31 by zzpnuli111
[考研] 纺织、生物、化学、材料等专业 +3 Eember. 2026-03-05 7/350 2026-03-05 16:35 by Eember.
[考研] 材料专硕346求调剂 +3 旺一下 2026-03-04 3/150 2026-03-04 16:26 by sslc1985
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭