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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2026级博士研究生招生报考通知(长期有效)
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jghe

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】模拟分子在室温下的稳定性用哪个系综?

本人不懂分子动力学,想模拟分子在室温下的稳定性用哪个系综?应该注意什么?谢谢!

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-16 at 13:33 ]
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superdirac

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 6-1 10:21
NPT系综 : 恒温恒压

只是恒温的话就用 :NVT,(正则系综)
我认为,酒一口一口喝,路一步一步走~步子迈大了,喀~容易扯着蛋
2楼2009-06-01 09:58:06
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

★ ★
xuefei06(金币+2,VIP+0):3Q! 6-1 11:11
一本都是NPT。但你与平衡的时候先跑几nm的NVT。等温度与压力恒定了再跑NPT
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
3楼2009-06-01 10:38:59
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xuefei06

木虫 (正式写手)

★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 6-1 13:45
NVE,NTV,NTP都行,一般是做NTP体系,不过你最好都做一下比较比较。
4楼2009-06-01 11:11:02
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jghe

金虫 (著名写手)

谢谢各位的热心回答,我用VASP作,具体怎么设置能讲一下吗?我看文献上说在300k 作动力学,测试体系的稳定性,应该用哪一个,NTV,NTP?
5楼2009-06-01 11:44:00
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 6-1 14:38
我已经说的很清楚了啊,你做NVT几纳秒,然后再做NTP。要先预平衡一下的吧。你体系的总能量也要先最小化
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
6楼2009-06-01 14:18:07
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jghe

金虫 (著名写手)

谢谢!
7楼2009-06-01 17:13:51
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