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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 求解：DH5α菌中某基因的上下游同源臂如何查找
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prthefu

木虫 (著名写手)

[求助] 求解：DH5α菌中某基因的上下游同源臂如何查找已有1人参与

请教一下，DH5α是某一种大肠杆菌，但是它具体是哪种大肠杆菌呢。
大家经常提到DH5α感受态细胞，但是它的基因组测序是否已知或者上传到数据库当中呢？
现在想找DH5α菌中的某个基因，做敲除，但是不知道怎么找目的基因的上下游同源臂？
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1楼2019-08-12 17:25:29
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sannny

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
基因组数据是有的，你在数据库中下载下来就可以了。然后查找你的目的基因在那里，再分析。

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prthefu
2楼2019-08-12 18:09:14
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biosci

捐助贵宾 (职业作家)
大肠杆菌k12株

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3楼2019-08-12 22:37:21
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prthefu

木虫 (著名写手)
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2楼: Originally posted by sannny at 2019-08-12 18:09:14
基因组数据是有的，你在数据库中下载下来就可以了。然后查找你的目的基因在那里，再分析。

明天跟你详细请教，看到回复请留意，感谢！

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4楼2019-08-12 22:58:36
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prthefu

木虫 (著名写手)
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3楼: Originally posted by biosci at 2019-08-12 22:37:21
大肠杆菌k12株

这是什么意思？

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5楼2019-08-12 22:58:50
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biosci

捐助贵宾 (职业作家)
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5楼: Originally posted by prthefu at 2019-08-12 22:58:50
这是什么意思？
...

查这个菌的基因组就可以了

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6楼2019-08-13 20:47:59
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prthefu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by biosci at 2019-08-13 20:47:59
查这个菌的基因组就可以了
...

k12也就是我们常用的DH5α菌株吗？

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7楼2019-08-13 21:43:30
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biosci

捐助贵宾 (职业作家)
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7楼: Originally posted by prthefu at 2019-08-13 21:43:30
k12也就是我们常用的DH5α菌株吗？
...

dh5是k12菌株衍生株

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8楼2019-08-14 13:18:55
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prthefu

木虫 (著名写手)
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8楼: Originally posted by biosci at 2019-08-14 13:18:55
dh5是k12菌株衍生株
...

好的，我知道了，谢谢啦，有问题再向您请教，感谢！
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9楼2019-08-14 13:48:32
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prthefu

木虫 (著名写手)
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2楼: Originally posted by sannny at 2019-08-12 18:09:14
基因组数据是有的，你在数据库中下载下来就可以了。然后查找你的目的基因在那里，再分析。

你好，我想问一下，我怎么在NCBI上找DH5α菌的某个基因情况呢，
我只能查到 Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655, complete genome
但是，对于其中一个基因，我以上面的为准，找到的基因序列和文献中的不同，
文章里提到是大肠杆菌DH5α，但是文章中序列比数据库中少近四五十bp，
只有前引物一样，后引物都不对。
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10楼2019-08-21 16:41:15
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