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prthefu

木虫 (著名写手)

[求助] 求解:DH5α菌中某基因的上下游同源臂如何查找 已有1人参与

请教一下,DH5α是某一种大肠杆菌,但是它具体是哪种大肠杆菌呢。
大家经常提到DH5α感受态细胞,但是它的基因组测序是否已知或者上传到数据库当中呢?
现在想找DH5α菌中的某个基因,做敲除,但是不知道怎么找目的基因的上下游同源臂?
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nothing is impossible in this world,if you have the will to win,you can achieve anything
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sannny

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
基因组数据是有的,你在数据库中下载下来就可以了。然后查找你的目的基因在那里,再分析。

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2楼2019-08-12 18:09:14
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biosci

捐助贵宾 (职业作家)


3楼2019-08-12 22:37:21
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prthefu

木虫 (著名写手)

送红花一朵
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2楼: Originally posted by sannny at 2019-08-12 18:09:14
基因组数据是有的,你在数据库中下载下来就可以了。然后查找你的目的基因在那里,再分析。

明天跟你详细请教,看到回复请留意,感谢!

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nothing is impossible in this world,if you have the will to win,you can achieve anything
4楼2019-08-12 22:58:36
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prthefu

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by biosci at 2019-08-12 22:37:21
大肠杆菌k12株

这是什么意思?

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5楼2019-08-12 22:58:50
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biosci

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5楼: Originally posted by prthefu at 2019-08-12 22:58:50
这是什么意思?
...

查这个菌的基因组就可以了

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6楼2019-08-13 20:47:59
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prthefu

木虫 (著名写手)

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6楼: Originally posted by biosci at 2019-08-13 20:47:59
查这个菌的基因组就可以了
...

k12也就是我们常用的DH5α菌株吗?

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7楼2019-08-13 21:43:30
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biosci

捐助贵宾 (职业作家)


引用回帖:
7楼: Originally posted by prthefu at 2019-08-13 21:43:30
k12也就是我们常用的DH5α菌株吗?
...

dh5是k12菌株衍生株

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8楼2019-08-14 13:18:55
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prthefu

木虫 (著名写手)

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8楼: Originally posted by biosci at 2019-08-14 13:18:55
dh5是k12菌株衍生株
...

好的,我知道了,谢谢啦,有问题再向您请教,感谢!
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9楼2019-08-14 13:48:32
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prthefu

木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sannny at 2019-08-12 18:09:14
基因组数据是有的,你在数据库中下载下来就可以了。然后查找你的目的基因在那里,再分析。

你好,我想问一下,我怎么在NCBI上找DH5α菌的某个基因情况呢,
我只能查到 Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655, complete genome
但是,对于其中一个基因,我以上面的为准,找到的基因序列和文献中的不同,
文章里提到是大肠杆菌DH5α,但是文章中序列比数据库中少近四五十bp,
只有前引物一样,后引物都不对。
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10楼2019-08-21 16:41:15
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