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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 求解：DH5α菌中某基因的上下游同源臂如何查找
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prthefu

木虫 (著名写手)

[求助] 求解：DH5α菌中某基因的上下游同源臂如何查找 已有1人参与

请教一下，DH5α是某一种大肠杆菌，但是它具体是哪种大肠杆菌呢。
大家经常提到DH5α感受态细胞，但是它的基因组测序是否已知或者上传到数据库当中呢？
现在想找DH5α菌中的某个基因，做敲除，但是不知道怎么找目的基因的上下游同源臂？
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1楼 2019-08-12 17:25:29
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prthefu

木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sannny at 2019-08-12 18:09:14
基因组数据是有的，你在数据库中下载下来就可以了。然后查找你的目的基因在那里，再分析。

你好，我想问一下，我怎么在NCBI上找DH5α菌的某个基因情况呢，
我只能查到 Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655, complete genome
但是，对于其中一个基因，我以上面的为准，找到的基因序列和文献中的不同，
文章里提到是大肠杆菌DH5α，但是文章中序列比数据库中少近四五十bp，
只有前引物一样，后引物都不对。
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10楼2019-08-21 16:41:15
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sannny

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
基因组数据是有的，你在数据库中下载下来就可以了。然后查找你的目的基因在那里，再分析。

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prthefu
2楼2019-08-12 18:09:14
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biosci

捐助贵宾 (职业作家)
大肠杆菌k12株

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3楼2019-08-12 22:37:21
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prthefu

木虫 (著名写手)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by sannny at 2019-08-12 18:09:14
基因组数据是有的，你在数据库中下载下来就可以了。然后查找你的目的基因在那里，再分析。

明天跟你详细请教，看到回复请留意，感谢！

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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4楼2019-08-12 22:58:36
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