| 查看: 2540 | 回复: 29 | |||
[交流]
mcsqs
|
|||
|
有谁知道mcsqs具体怎么用么，特别是-2-3的选择，以及最后如何选择一个最好的结构 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有8人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有4人回复
-
售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急
已经有4人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有6人回复
-
售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急
已经有6人回复
-
售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急
已经有4人回复
-
某top大学教授说“能够在市场中兑现的能力才是真能力”无比同意！
已经有13人回复
13楼2019-07-27 13:06:15
15楼2019-07-27 14:31:52
★
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
|
-2=[real] Maximum distance between two points within a pair (Default: 0) -3=[real] Maximum distance between two points within a triplet (Default: 0) -4=[real] Maximum distance between two points within a quadruplet (Default: 0) -5=[real] Maximum distance between two points within a quintuplet (Default: 0) -6=[real] Maximum distance between two points within a sextuplet (Default: 0) 我问过作者，选择pair, triplet, quadruplet 的大小，不同的研究里面也没有统一的标准。虽然说越大越好，但是太大了也非常影响计算时间。我读过的一些文章里面，最多是用到second nearest pairs，second nearest triplets，还有second nearest quadruplets。 评定它的混乱程度看你的target function 和你的correlation function 的差值是多少，这个差值越低越好。 |
19楼2019-07-29 21:03:06
|
请问你所说的差值，是值得bestcorr.out第五列的值么？我理解的objective function表示的含义就是目标关联函数和实际模拟出来的差值，你看对么 发自小木虫Android客户端 |
20楼2019-07-29 21:09:02
|
是的，是第五列。 我忘了他在哪里说过，单看objective function = xxxx这一个数值好像是没有什么参考价值。 一个比较的方法是，按照1st NN pair, 2nd NN pair ...这样的顺序，把第五列的值加起来。 例子： 2 2.528850 0.111111 0.111111 -0.000000 2 2.537153 0.111111 0.111111 -0.000000 2 3.582210 0.111111 0.111111 -0.000000 2 3.582210 0.111111 0.111111 -0.000000 3 2.537153 0.037037 0.037037 -0.000000 3 2.537153 0.037037 0.037037 -0.000000 这里有1st NN pair （第一第二行）, 2nd NN pair （第三第四行）, 1st NN triplet （第五第六行）. 分别加起来。看第五列加起来的数，比较齐第三列加起来的数。我看的文章都有报道这些数字，如果他们相差很远，那就是一个可以接受的SQS。具体是多少的话其实还没有标准。SQS能大就大一些，毕竟这样更加接近ideal solution，在不牺牲太多计算时间的情况下，尽量大一些（60个以上吧）。多做几个SQS，比较他们之间这些值，在他们之间选一个合适的。对于这些correlation function difference的值，我自己的经验是correlation function difference/correlation function < 某个值。这个值在不同系统是不一样的。没有人做过这方面的研究，也只能看经验。 |
25楼2019-07-29 23:38:51
26楼2019-07-30 07:28:57
28楼2019-07-30 15:34:04
30楼2020-05-20 15:17:30
简单回复
nono20092楼
2019-07-25 09:46
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
`
小蘑菇づ3楼
2019-07-25 10:14
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
， 发自小木虫Android客户端
youngen4楼
2019-07-25 10:45
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
德安缘科技5楼
2019-07-25 11:24
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
2019-07-25 11:32
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
2019-07-25 13:04
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
2019-07-25 21:59
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
tzynew9楼
2019-07-25 22:42
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
ckxbear10楼
2019-07-25 22:54
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
muzi010411楼
2019-07-26 07:46
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
111
胡小虾12楼
2019-07-26 15:42
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
祝福
gongzilu14楼
2019-07-27 13:47
回复
slytjiaofei16楼
2019-07-27 18:46
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
小蘑菇づ17楼
2019-07-27 18:54
回复
yijibang18楼
2019-07-27 19:10
回复
小幸运78921楼
2019-07-29 21:51
回复
晴天见你22楼
2019-07-29 22:41
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
， 发自小木虫Android客户端
yh050423楼
2019-07-29 22:55
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
。 发自小木虫Android客户端
tangbohejin24楼
2019-07-29 23:16
回复
追梦的流年27楼
2019-07-30 07:29
回复
youngen29楼
2019-07-31 14:15
回复
