| 查看: 2202 | 回复: 29 | |||
[交流]
mcsqs
|
|||
|
有谁知道mcsqs具体怎么用么，特别是-2-3的选择，以及最后如何选择一个最好的结构 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
职称评审没过，求安慰
已经有49人回复
-
26申博自荐
已经有3人回复
-
A期刊撤稿
已经有4人回复
-
垃圾破二本职称评审标准
已经有17人回复
-
投稿Elsevier的Neoplasia杂志，到最后选publishing options时页面空白，不能完成投稿
已经有22人回复
-
EST投稿状态问题
已经有7人回复
-
毕业后当辅导员了，天天各种学生超烦
已经有4人回复
-
三无产品还有机会吗
已经有6人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
推荐给英语教学者的一本单词书《金鱼单词讲义：从26个拉丁字母到106万个英语单词》
+3/906
-
DIY科研工具交流
+1/213
-
Analytical Science Advances 征稿中
+1/185
-
新加坡国立大学张阳教授课题组招聘博士后（AI与生物医学方向）
+1/181
-
Analytical Science Advances（Wiley出版社）长期征稿中...
+1/98
-
【高温摩擦磨损试验机】接样/预存款服务
+1/84
-
山东第二医科大学和广州中医药大学药学硕士招生
+1/84
-
天津大学化学系吴立朋课题组申请考核制博士招生/博后招聘
+1/84
-
天津大学化学系吴立朋课题组申请考核制博士招生/博后招聘
+1/84
-
上海大学理学院纳米纤维化学（NFC）研究团队2026级学术学位博士招生
+1/78
-
中国科学院山西煤炭化学研究所水污染防治与资源化利用方向招本科/硕士线上实习生
+1/78
-
清华大学药学院卢磊课题组诚聘新药研发方向科研助理
+1/76
-
SCI计算机相关论文
+1/10
-
北理工柔性电子国家杰青团队招博士后及科研助理
+1/9
-
海南师范大学招收化学博士（光电功能材料课题组招收博士研究生）
+1/8
-
SCI，计算机相关可以写
+1/5
-
诚邀博士后合作研究人员
+1/4
-
有没有做核磁共振系统的虫友呢
+1/4
-
英国兰卡斯特大学（Lancaster University）大模型、计算机视觉PhD招生
+1/2
-
中国科大电池方向任晓迪课题组招收2026级博士生-电解液/电池安全性/人工智能方向
+1/2
13楼2019-07-27 13:06:15
15楼2019-07-27 14:31:52
★
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
|
-2=[real] Maximum distance between two points within a pair (Default: 0) -3=[real] Maximum distance between two points within a triplet (Default: 0) -4=[real] Maximum distance between two points within a quadruplet (Default: 0) -5=[real] Maximum distance between two points within a quintuplet (Default: 0) -6=[real] Maximum distance between two points within a sextuplet (Default: 0) 我问过作者，选择pair, triplet, quadruplet 的大小，不同的研究里面也没有统一的标准。虽然说越大越好，但是太大了也非常影响计算时间。我读过的一些文章里面，最多是用到second nearest pairs，second nearest triplets，还有second nearest quadruplets。 评定它的混乱程度看你的target function 和你的correlation function 的差值是多少，这个差值越低越好。 |
19楼2019-07-29 21:03:06
|
请问你所说的差值，是值得bestcorr.out第五列的值么？我理解的objective function表示的含义就是目标关联函数和实际模拟出来的差值，你看对么 发自小木虫Android客户端 |
20楼2019-07-29 21:09:02
|
是的，是第五列。 我忘了他在哪里说过，单看objective function = xxxx这一个数值好像是没有什么参考价值。 一个比较的方法是，按照1st NN pair, 2nd NN pair ...这样的顺序，把第五列的值加起来。 例子： 2 2.528850 0.111111 0.111111 -0.000000 2 2.537153 0.111111 0.111111 -0.000000 2 3.582210 0.111111 0.111111 -0.000000 2 3.582210 0.111111 0.111111 -0.000000 3 2.537153 0.037037 0.037037 -0.000000 3 2.537153 0.037037 0.037037 -0.000000 这里有1st NN pair （第一第二行）, 2nd NN pair （第三第四行）, 1st NN triplet （第五第六行）. 分别加起来。看第五列加起来的数，比较齐第三列加起来的数。我看的文章都有报道这些数字，如果他们相差很远，那就是一个可以接受的SQS。具体是多少的话其实还没有标准。SQS能大就大一些，毕竟这样更加接近ideal solution，在不牺牲太多计算时间的情况下，尽量大一些（60个以上吧）。多做几个SQS，比较他们之间这些值，在他们之间选一个合适的。对于这些correlation function difference的值，我自己的经验是correlation function difference/correlation function < 某个值。这个值在不同系统是不一样的。没有人做过这方面的研究，也只能看经验。 |
25楼2019-07-29 23:38:51
26楼2019-07-30 07:28:57
28楼2019-07-30 15:34:04
30楼2020-05-20 15:17:30
简单回复
nono20092楼
2019-07-25 09:46
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
`
小蘑菇づ3楼
2019-07-25 10:14
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
， 发自小木虫Android客户端
youngen4楼
2019-07-25 10:45
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
德安缘科技5楼
2019-07-25 11:24
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
2019-07-25 11:32
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
2019-07-25 13:04
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
2019-07-25 21:59
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
tzynew9楼
2019-07-25 22:42
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
ckxbear10楼
2019-07-25 22:54
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
muzi010411楼
2019-07-26 07:46
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
111
胡小虾12楼
2019-07-26 15:42
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
祝福
gongzilu14楼
2019-07-27 13:47
回复
slytjiaofei16楼
2019-07-27 18:46
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
小蘑菇づ17楼
2019-07-27 18:54
回复
yijibang18楼
2019-07-27 19:10
回复
小幸运78921楼
2019-07-29 21:51
回复
晴天见你22楼
2019-07-29 22:41
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
， 发自小木虫Android客户端
yh050423楼
2019-07-29 22:55
回复
Bachelor.(金币+2): 谢谢参与
。 发自小木虫Android客户端
tangbohejin24楼
2019-07-29 23:16
回复
追梦的流年27楼
2019-07-30 07:29
回复
youngen29楼
2019-07-31 14:15
回复