24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (4576)
>导师招生 (975)
>考研 (327)
>文献求助 (318)
>招聘信息布告栏 (270)
>硕博家园 (263)
>考博 (232)
>虫友互识 (221)
>博后之家 (214)
>生物材料 (143)
>找工作 (124)
>海外博后 (112)
>休闲灌水 (57)
>论文投稿 (43)
>基金申请 (34)
>教师之家 (30)

返回列表

当前主题已经存档。

gwdavid

木虫 (著名写手)

小木虫散兵坑坑长

应助: 0 (幼儿园)
贵宾: 0.522
金币: 4097.7
散金: 1548
红花: 57
帖子: 1768
在线: 151.2小时
虫号: 514002
注册: 2008-02-28
性别: GG
专业: 生化分析及生物传感

[交流] 【求助】gromacs中的LJ-SR和LJ-LR表示什么？

我用gromacs跑了一个受体配体复合物的动力学模拟，ndx文件包含以下四部分：protein, SIM, SOL, NA+. 在我用g_energy提取能量时遇到了几个问题，请教一下：

1. 图中7， 8， 9 ，10 项各表示什么？从哪里可以查到？
2. 图中lamb-Protein等带lamb的表示什么？
3. 这里没有Protein-SIM的相互作用项，好像需要rerun，但为什么我一rerun他就说我的输入文件和轨迹文件的原子数不对啊？

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-13 at 21:42 ]

回复此楼