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gwdavid木虫 (著名写手)
小木虫散兵坑坑长
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[交流]
【求助】gromacs中的LJ-SR和LJ-LR表示什么?
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我用gromacs跑了一个受体配体复合物的动力学模拟,ndx文件包含以下四部分:protein, SIM, SOL, NA+. 在我用g_energy提取能量时遇到了几个问题,请教一下: 1. 图中7, 8, 9 ,10 项各表示什么?从哪里可以查到? 2. 图中lamb-Protein等带lamb的表示什么? 3. 这里没有Protein-SIM的相互作用项,好像需要rerun,但为什么我一rerun他就说我的输入文件和轨迹文件的原子数不对啊? [ Last edited by lei0736 on 2009-11-13 at 21:42 ] |
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2楼2009-05-27 17:55:14











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