应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 保守序列怎么找出来
51/1返回列表
查看: 2259  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

xiaorong-er

金虫 (正式写手)

[交流] 保守序列怎么找出来

我现在要根据一个物种的某个基因的保守区来设计引物，但是不知道怎么把保守区调出来？我只知道在DNAMAN和NCBI上用blast比较二个物种的mRNA序列和氨基酸序列，但是怎么把它们相同的部分给弄出来。希望有人可以指点，谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-05-20 10:53:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaorong-er

金虫 (正式写手)
CDS区时氨基酸序列，我怎么把它们转变成核苷酸序列呢？对这块还是不很懂，有没有详细的资料说怎么去比对设计引物的？
赞一下 回复此楼
8楼2009-05-21 15:13:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

doctorlx8058

★
xiaorong-er(金币+1,VIP+0): 5-20 14:58
你好，在做实时定量PCR时也要求设计特异性引物序列。一般情况下，我们是在GENEBANK中下载相关基因序列，在详细信息中找到CDS区，一般情况下，CDS区时相对保守的。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2009-05-20 11:17:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

amilie030312

金虫 (正式写手)
★
xiaorong-er(金币+1,VIP+0): 5-20 14:58
找到所有NCBI上登陆的所有物种的该基因的CDS区，然后用软件来进行同源性对比，推荐你用BioEdit，我个人觉得满好用的。先找同源性比较好的地方用引物设计软件看出不出引物，如果不出，其他的部位如果引物出的很好但同源性不好做普通PCR的话可以设置兼并碱基，如果做定量的话那没办法只能按照物种同源性更接近的那个先来试了。
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2009-05-20 12:45:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaorong-er

金虫 (正式写手)
哦，我是要做半定量PCR的，我先要找到这个物种的保守区设计引物扩增另一物种，得到目的片段后再来设计引物。
赞一下 回复此楼
4楼2009-05-20 14:16:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 312求调剂 +3 上岸吧ZJY 2026-03-22 5/250 2026-03-25 14:50 by 雾散后相遇lc
[考研] 081700 调剂 267分 +10 迷人的哈哈 2026-03-23 10/500 2026-03-25 12:12 by userper
[考研] 287求调剂 +10 晨昏线与星海 2026-03-19 11/550 2026-03-25 10:35 by userper
[考研] 286求调剂 +11 Faune 2026-03-21 11/550 2026-03-25 10:11 by 雾散后相遇lc
[考研] 材料调剂 +6 匹克i 2026-03-23 6/300 2026-03-24 21:09 by greychen00
[考研] 一志愿北化315 求调剂 +3 akrrain 2026-03-24 3/150 2026-03-24 19:35 by 了了了了。。
[考研] 一志愿211 初试270分 求调剂 +5 谷雨上岸 2026-03-23 6/300 2026-03-24 16:32 by laoshidan
[考研] 一志愿华东理工大学081700，初试分数271 +5 kotoko_ik 2026-03-23 6/300 2026-03-24 10:29 by 学术搬砖er
[基金申请] 请教下大家 2026年国家基金申请是双盲审吗？ +3 lishucheng1 2026-03-22 5/250 2026-03-24 08:22 by gltch
[考研] 环境学硕288求调剂 +8 皮皮皮123456 2026-03-22 8/400 2026-03-23 23:47 by 热情沙漠
[考研] 316求调剂 +7 梁茜雯 2026-03-19 7/350 2026-03-23 16:21 by lingjue
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 求调剂 +3 白QF 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:12 by zhukairuo
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 308求调剂 +3 阿姐阿姐家啊 2026-03-18 3/150 2026-03-20 23:24 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 西北大学 ，070300化学学硕，总分287，双非一本，求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-20 5/250 2026-03-20 20:16 by JourneyLucky
[考研] 材料考研调剂 +3 xwt。 2026-03-19 3/150 2026-03-19 11:22 by w沐阳w
[考研] 本科郑州大学物理学院，一志愿华科070200学硕，346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭