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Hope225521

新虫 (初入文坛)

[交流] 被子植物353个单拷贝核基因靶向捕获试剂盒-研究植物系统分类和进化的利器

被子植物353个单拷贝核基因靶向捕获试剂盒-研究植物系统分类和进化的利器
Plant Universal — Angiosperms 353

产品概述
myBaits Angiosperms 353是从600种被子植物中,筛选353个单拷贝核基因,作为捕获序列,利用k-medoid聚类法设计靶向捕获探针,生物素化的RNA探针长度120 bp,对被子植物的353个单拷贝核基因进行定向捕获测序。平均每个物种覆盖283个基因,所有被子植物至少覆盖100个直系同源单拷贝核基因。每个物种至少靶向137 kbp,最大捕获区域为250 kbp,另外覆盖了212 kbp的非编码区。

产品特点
低起始量-1 ng-3 μg,推荐100-500 ng
覆盖广-捕获覆盖整个目标序列
兼容性-兼容NGS文库制备,允许多个碱基错配
高精度-近缘和远缘的个体或者种群精准捕获,不引入biases
低投入-节约时间成本和经费成本
高通量-多个文库同一反应进行,每个反应pooling 2-16个样本
通用性-适用于被子植物的系统进化分析,建立DNA条形码

产品应用
系统发生学
进化关系的分析
内含子测序
发现可变区域
DNA Barcoding
对目标序列的富集程度进行评价
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