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suntqliyan

金虫 (小有名气)

[求助] 请教:结构基本解析出来,但R因子太高,是因为数据质量差,还是别的原因? 已有2人参与

新手小白碰到问题,请有经验者帮忙看看附件中的结构!

一个简单的酸式磷酸盐,除了氢原子以外的原子都已指认。
目前各指标如下: R(int) = 0.1406,R(sigma) = 0.1106 ,R1 = 15.49%,wR2 = 40.69%。
是不是数据质量差,所以R因子降不下来呢?
另外,如果各向异性精修,大部分原子都会非正定(btw:数据是低温下收的),碰到这种情况一般怎么办?
残余峰中似乎也没看到合适的氢原子,这种情况下如何加氢呢?

请指教!谢谢!
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  • 附件 1 : test.zip
  • 2019-04-14 07:55:33, 121.09 K

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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信


★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
suntqliyan: 金币+25, ★★★很有帮助 2019-04-16 09:03:23
suntqliyan: 金币+5 2019-04-16 09:03:53
本帖仅楼主可见

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2019-04-14 18:58:02
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Tab呱呱

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
suntqliyan: 金币+15, 有帮助 2019-04-16 09:02:54
首先测得不好,空间群需要升对称性,建议重新在还原数据时做吸收校正

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2019-04-14 12:42:54
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suntqliyan

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by Tab呱呱 at 2019-04-14 12:42:54
首先测得不好,空间群需要升对称性,建议重新在还原数据时做吸收校正

感谢您的回复!
确实现在对称性比较低,目前P-1空间群。
请教您是通过什么方面判断需要升对称性的?
用xprep确定空间群时,最高的对称性就是P-1了。
另外,关于吸收校正,是做经验校正呢,还是数字校正?
3楼2019-04-14 16:06:22
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Tab呱呱

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by suntqliyan at 2019-04-14 16:06:22
感谢您的回复!
确实现在对称性比较低,目前P-1空间群。
请教您是通过什么方面判断需要升对称性的?
用xprep确定空间群时,最高的对称性就是P-1了。
另外,关于吸收校正,是做经验校正呢,还是数字校正?...

Platon 检查对称性,实际上看晶胞就能判断了。明显接近90度

发自小木虫IOS客户端
5楼2019-04-14 19:28:52
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