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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 请教：结构基本解析出来，但R因子太高，是因为数据质量差，还是别的原因？
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suntqliyan

金虫 (小有名气)

[求助] 请教：结构基本解析出来，但R因子太高，是因为数据质量差，还是别的原因？ 已有2人参与

新手小白碰到问题，请有经验者帮忙看看附件中的结构！

一个简单的酸式磷酸盐，除了氢原子以外的原子都已指认。
目前各指标如下： R(int) = 0.1406，R(sigma) = 0.1106 ，R1 = 15.49%，wR2 = 40.69%。
是不是数据质量差，所以R因子降不下来呢？
另外，如果各向异性精修，大部分原子都会非正定（btw：数据是低温下收的），碰到这种情况一般怎么办？
残余峰中似乎也没看到合适的氢原子，这种情况下如何加氢呢？

请指教！谢谢！
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  • 附件 1 : test.zip
    • 2019-04-14 07:55:33, 121.09 K

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1楼 2019-04-14 07:57:13
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Tab呱呱

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
suntqliyan: 金币+15, ★有帮助 2019-04-16 09:02:54
首先测得不好，空间群需要升对称性，建议重新在还原数据时做吸收校正
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suntqliyan
2楼2019-04-14 12:42:54
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suntqliyan

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by Tab呱呱 at 2019-04-14 12:42:54
首先测得不好，空间群需要升对称性，建议重新在还原数据时做吸收校正

感谢您的回复！
确实现在对称性比较低，目前P-1空间群。
请教您是通过什么方面判断需要升对称性的？
用xprep确定空间群时，最高的对称性就是P-1了。
另外，关于吸收校正，是做经验校正呢，还是数字校正？
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3楼2019-04-14 16:06:22
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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
suntqliyan: 金币+25, ★★★很有帮助 2019-04-16 09:03:23
suntqliyan: 金币+5 2019-04-16 09:03:53
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suntqliyan
4楼2019-04-14 18:58:02
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Tab呱呱

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by suntqliyan at 2019-04-14 16:06:22
感谢您的回复！
确实现在对称性比较低，目前P-1空间群。
请教您是通过什么方面判断需要升对称性的？
用xprep确定空间群时，最高的对称性就是P-1了。
另外，关于吸收校正，是做经验校正呢，还是数字校正？...

Platon 检查对称性，实际上看晶胞就能判断了。明显接近90度

发自小木虫IOS客户端
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5楼2019-04-14 19:28:52
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suntqliyan

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by lich666 at 2019-04-14 18:58:02
实际上应该是P21/n空间群，无机的结构最忌讳数据差了，本来点不多，Rint还这么高，肯定结果不好，再测数据吧。

谢谢专家回复！
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6楼2019-04-16 08:56:30
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suntqliyan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by Tab呱呱 at 2019-04-14 19:28:52
Platon 检查对称性，实际上看晶胞就能判断了。明显接近90度
...

嗯，看晶胞参数确实怀疑是单斜的。但是P21/n是用Platon检查出的吗？我试试这软件。多谢您！
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7楼2019-04-16 08:57:30
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suntqliyan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lich666 at 2019-04-14 18:58:02
实际上应该是P21/n空间群，无机的结构最忌讳数据差了，本来点不多，Rint还这么高，肯定结果不好，再测数据吧。

我用platon的addsym检查了对称性，给出了可能的劳厄群为2/m，具体如附件。
pdf库中的报道的粉末数据确实是P21/n，您好厉害，膜拜！
不知您是怎么推出来的的？再次请教您。能否简单谈谈，多谢！
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8楼2019-04-16 09:17:45
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suntqliyan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by suntqliyan at 2019-04-16 09:17:45
我用platon的addsym检查了对称性，给出了可能的劳厄群为2/m，具体如附件。
pdf库中的报道的粉末数据确实是P21/n，您好厉害，膜拜！
不知您是怎么推出来的的？再次请教您。能否简单谈谈，多谢！...

刚才手快，忘贴附件了
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  • 附件 1 : platon.JPG
    • 2019-04-16 09:19:58, 72.67 K
9楼2019-04-16 09:20:15
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匿名

用户注销 (知名作家)

精修问题可私信
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10楼2019-04-16 11:06:39
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