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ocina铁杆木虫 (著名写手)
小菜虫
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Gaussview计算得到的红外光谱图纵坐标转换 已有1人参与
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| 红外光谱图纵坐标是Transmittance或Absorbance，而用Gaussview计算得到的谱图是红外光谱图纵坐标是Epsilon。请问这两种类型的图如何切换？急求，谢谢 |
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ocina
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5楼2019-04-10 13:22:19
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【答案】应助回帖
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zhou2009: 金币+8 2019-04-10 10:05:23
ocina: 金币+50, ★★★很有帮助 2019-04-10 19:40:07
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ocina: 金币+50, ★★★很有帮助 2019-04-10 19:40:07
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以下是我知道的 我对中间的一些数学操作也不是搞得太清楚。有啥错误之处就到时候请大牛来指正了。定性的来说说。 实验的红外光谱通常用的Abs和 T%。 要和高斯得到的振子强度挂钩就得用到朗伯比尔定律 Abs=ε *c *L 这里面 c和L是和物质分子本身没有关系的 所以高斯不考虑 高斯给出的那个红外强度实际上就是 跟ε挂钩的。也就是你看到Gaussview里显示的 Epsilon 这ε单位是 L /mol /cm 如果查看输出文件， 计算出来的IR振子强度 单位是 KM/mol 而所谓一个振动模式的振动强度定义是 用频率对ε 积分 对应实验中的红外光谱 实际上就是在某一个频率范围内的吸光度（实验光谱中的峰面积） 做了积分之后 L/mol/cm 相当于乘以一个频率（cm-1。 那这样量纲就变为了 跟高斯生成的KM/mol 一样的了。 回到计算上来。算出来的IR光谱是一个一个的振子强度 放在图上就是一条竖线 没有面积，所以看起来和实验肯定是不一样的。所以这样就需要反过来操作，也就是把这个竖线展宽。 把对应的振子强度 用某种规则进行展宽后的曲线每一点的纵坐标就可以对应ε，也就是摩尔吸光度。 IR的计算光谱通常是用洛伦兹函数来展宽。展宽之后的计算光谱就可以和实验光谱比较了。 既然涉及到展宽，那自己手算比较麻烦。Gaussview 是可以在程序里帮你展宽的，在光谱上点击右键 properties里 只需要设置半峰宽就可以了 大家一般最关心的是IR光谱的横坐标也就是频率。每个峰之间相对的峰面积比较也有些价值。因为这对应了振子强度的大小。而纵坐标abs或者T%本身的绝对数值一般就并不那么关心了。 |
2楼2019-04-10 02:02:19
ocina
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3楼2019-04-10 10:16:19
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4楼2019-04-10 11:05:08