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ychh521

木虫 (小有名气)

[交流] 我所总结的AFLP分子标记的要点

现在仍然有很多实验室在做AFLP分子标记,但可能会遇到一些问题,主要是重复性不好,有时候能够扩出来,有时候扩不出来,再有就是跑聚丙烯的时候差异带可能是700bp,但回收后就变成了200多,也就是在聚丙烯板上看到的和回收的片段不一样打,对于这几个问题,现总结如下,希望对大家有所帮助,同时也希望同行们不吝赐教。
      第一,所提取的基因组DNA必须保持完整,不断裂,还要经过纯化,除去蛋白,多糖,酚类及RNA等杂质,否则影响酶切效果。
      第二,尽量用大公司生产的内切酶。
      第三,接头让公司直接合成,尽量不要合成单链自己退火结合,大一点的公司如宝生物就能合成双链接头,只是稍贵了一点。
      第四,如果跑非变性胶的话,直接点marker就行了,要是跑变性胶,扩增产物变性的同时,marker也要变性。
      第五,要把每一次跑板都当成是能够跑出差异片段来做,尽最大努力做好每一天的实验。
      如有不周之处,敬请指教!
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zhuimengren639

荣誉版主 (文坛精英)

阿弥陀佛

文献杰出贡献优秀版主

支持一下,分享的经验不错!
2楼2009-05-16 14:30:39
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疯狂修行者

木虫 (正式写手)

关键是老板肯不肯花钱
戒骄戒躁,坦荡做人,平常心做事,享受生活之美!!
3楼2009-10-09 22:32:02
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