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我所总结的AFLP分子标记的要点
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现在仍然有很多实验室在做AFLP分子标记,但可能会遇到一些问题,主要是重复性不好,有时候能够扩出来,有时候扩不出来,再有就是跑聚丙烯的时候差异带可能是700bp,但回收后就变成了200多,也就是在聚丙烯板上看到的和回收的片段不一样打,对于这几个问题,现总结如下,希望对大家有所帮助,同时也希望同行们不吝赐教。 第一,所提取的基因组DNA必须保持完整,不断裂,还要经过纯化,除去蛋白,多糖,酚类及RNA等杂质,否则影响酶切效果。 第二,尽量用大公司生产的内切酶。 第三,接头让公司直接合成,尽量不要合成单链自己退火结合,大一点的公司如宝生物就能合成双链接头,只是稍贵了一点。 第四,如果跑非变性胶的话,直接点marker就行了,要是跑变性胶,扩增产物变性的同时,marker也要变性。 第五,要把每一次跑板都当成是能够跑出差异片段来做,尽最大努力做好每一天的实验。 如有不周之处,敬请指教! |
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