24小时热门版块排行榜    

查看: 2947  |  回复: 8
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

悟空pillart

铜虫 (正式写手)

[求助] vasp无报错信息,但一直没办法运行 已有2人参与

VASP进行CeO2晶格优化,运行后OUTCAR无报错信息,但是也无能量输出,CONTCAR和OSZICAR也无数据,输入qstat查看任务状态时也是一直卡在35秒左右,过一段时间就自动终止了。附上各参数设置与pbs脚本!!!
SYSTEM=CeO2
ISTART=0
ICHARG=2
PREC=Normal
LREAL=.FALSE.
IBRION=2
ISIF=3
NSW=100
POTIM=0.5
EDIFFG=-0.05
ENCUT=400
ALGO=Fast
ISPIN=2
VOSKOWN=1
NCORE=4
NELM=100
EDIFF=0.1E-04
LWAVE=.FALSE.
LCHARG=.FALSE.
ISMEAR=0
SIGMA=0.2
LDAU=.TURE.
LDAUTYPE=2
LDAUL=-1 3
LDAUU=0 5.5
LDAUJ=0 0.5
LMAXMIX=6
++++++++++++++++
Automatic mesh
0
G
5 5 5
0 0 0
++++++++++++++++
CeO2
1.0
        0.0000000000         2.7030000500         2.7030000000
        2.7030000000         0.0000000500         2.7030000000
        2.7030000500         2.7030000000         0.0000000000
O   Ce
2    1
Direct
     0.250000000         0.250000000         0.250000000
     0.750000000         0.750000000         0.750000000
     0.000000000         0.000000000         0.000000000
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
PBS脚本部分
#!/bin/bash
#PBS -N vasp
#PBS -l nodes=1:ppn=36
#PBS -q gentai
cd $PBS_O_WORKDIR
NPROCS=`wc -l < $PBS_NODEFILE`
mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_std
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_ncl
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_gam
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_std
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_ncl
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_gam
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_std
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_ncl
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_gam
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

悟空pillart

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jmlv at 2019-04-01 11:26:38
我估计,作业压根就没开始算。OUTCAR包含哪些内容?

对,提交任务后立马输入top都没见vasp在运行,然后输入qstat一直卡在35秒左右,我将所有输出文件打包了,麻烦您给看一下。

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : vasp.rar
  • 2019-04-01 11:44:47, 135.84 K
5楼2019-04-01 11:44:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 9 个回答

Bachelor.

木虫 (著名写手)

运行的编号.out和.err有什么提示,有35秒证明算了,应该在.out文件里有说明

发自小木虫Android客户端
2楼2019-03-31 22:07:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jmlv

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我估计,作业压根就没开始算。OUTCAR包含哪些内容?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2019-04-01 11:26:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

悟空pillart

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Bachelor. at 2019-03-31 22:07:01
运行的编号.out和.err有什么提示,有35秒证明算了,应该在.out文件里有说明

好像没有out文件产生,不太懂那个怎么看,我把所有的输出文件已经打包了,如果方便的话麻烦您看一下。

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : vasp.rar
  • 2019-04-01 11:31:26, 135.84 K
4楼2019-04-01 11:42:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:50 by hZiFeudZyoGR
[博后之家] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 18:28 by hZiFeudZyoGR
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 7/350 2026-08-30 18:18 by hZiFeudZyoGR
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 5/250 2026-08-30 18:07 by hZiFeudZyoGR
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 6/300 2026-08-30 17:47 by hZiFeudZyoGR
[基金申请] 面上意见出来了 +9 黄鸟于飞Chao 2026-08-29 18/900 2026-08-30 16:47 by 黄鸟于飞Chao
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 9/450 2026-08-30 11:19 by l0VvVHGBGRLv
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 gy1nBQXYQJqL 2026-08-29 4/200 2026-08-30 06:57 by ZPa0EcMwuECS
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 G6APbkg8SA6w 2026-08-29 5/250 2026-08-30 02:40 by ZPa0EcMwuECS
[基金申请] 系统查不到 +11 董八千 2026-08-26 11/550 2026-08-28 18:06 by Leogzhya
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来!米来!面来! +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
信息提示
请填处理意见