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悟空pillart

铜虫 (正式写手)

[求助] vasp无报错信息,但一直没办法运行 已有2人参与

VASP进行CeO2晶格优化,运行后OUTCAR无报错信息,但是也无能量输出,CONTCAR和OSZICAR也无数据,输入qstat查看任务状态时也是一直卡在35秒左右,过一段时间就自动终止了。附上各参数设置与pbs脚本!!!
SYSTEM=CeO2
ISTART=0
ICHARG=2
PREC=Normal
LREAL=.FALSE.
IBRION=2
ISIF=3
NSW=100
POTIM=0.5
EDIFFG=-0.05
ENCUT=400
ALGO=Fast
ISPIN=2
VOSKOWN=1
NCORE=4
NELM=100
EDIFF=0.1E-04
LWAVE=.FALSE.
LCHARG=.FALSE.
ISMEAR=0
SIGMA=0.2
LDAU=.TURE.
LDAUTYPE=2
LDAUL=-1 3
LDAUU=0 5.5
LDAUJ=0 0.5
LMAXMIX=6
++++++++++++++++
Automatic mesh
0
G
5 5 5
0 0 0
++++++++++++++++
CeO2
1.0
        0.0000000000         2.7030000500         2.7030000000
        2.7030000000         0.0000000500         2.7030000000
        2.7030000500         2.7030000000         0.0000000000
O   Ce
2    1
Direct
     0.250000000         0.250000000         0.250000000
     0.750000000         0.750000000         0.750000000
     0.000000000         0.000000000         0.000000000
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
PBS脚本部分
#!/bin/bash
#PBS -N vasp
#PBS -l nodes=1:ppn=36
#PBS -q gentai
cd $PBS_O_WORKDIR
NPROCS=`wc -l < $PBS_NODEFILE`
mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_std
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_ncl
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_gam
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_std
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_ncl
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_gam
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_std
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_ncl
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_gam
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jmlv

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
我估计,作业压根就没开始算。OUTCAR包含哪些内容?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2019-04-01 11:26:38
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Bachelor.

木虫 (著名写手)

运行的编号.out和.err有什么提示,有35秒证明算了,应该在.out文件里有说明

发自小木虫Android客户端
2楼2019-03-31 22:07:01
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悟空pillart

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Bachelor. at 2019-03-31 22:07:01
运行的编号.out和.err有什么提示,有35秒证明算了,应该在.out文件里有说明

好像没有out文件产生,不太懂那个怎么看,我把所有的输出文件已经打包了,如果方便的话麻烦您看一下。

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  • 附件 1 : vasp.rar
  • 2019-04-01 11:31:26, 135.84 K
4楼2019-04-01 11:42:47
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悟空pillart

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jmlv at 2019-04-01 11:26:38
我估计,作业压根就没开始算。OUTCAR包含哪些内容?

对,提交任务后立马输入top都没见vasp在运行,然后输入qstat一直卡在35秒左右,我将所有输出文件打包了,麻烦您给看一下。

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  • 2019-04-01 11:44:47, 135.84 K
5楼2019-04-01 11:44:50
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