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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » vasp无报错信息，但一直没办法运行
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悟空pillart

铜虫 (正式写手)

[求助] vasp无报错信息，但一直没办法运行 已有2人参与

VASP进行CeO2晶格优化，运行后OUTCAR无报错信息，但是也无能量输出，CONTCAR和OSZICAR也无数据，输入qstat查看任务状态时也是一直卡在35秒左右，过一段时间就自动终止了。附上各参数设置与pbs脚本！！！
SYSTEM=CeO2
ISTART=0
ICHARG=2
PREC=Normal
LREAL=.FALSE.
IBRION=2
ISIF=3
NSW=100
POTIM=0.5
EDIFFG=-0.05
ENCUT=400
ALGO=Fast
ISPIN=2
VOSKOWN=1
NCORE=4
NELM=100
EDIFF=0.1E-04
LWAVE=.FALSE.
LCHARG=.FALSE.
ISMEAR=0
SIGMA=0.2
LDAU=.TURE.
LDAUTYPE=2
LDAUL=-1 3
LDAUU=0 5.5
LDAUJ=0 0.5
LMAXMIX=6
++++++++++++++++
Automatic mesh
0
G
5 5 5
0 0 0
++++++++++++++++
CeO2
1.0
        0.0000000000         2.7030000500         2.7030000000
        2.7030000000         0.0000000500         2.7030000000
        2.7030000500         2.7030000000         0.0000000000
O   Ce
2    1
Direct
     0.250000000         0.250000000         0.250000000
     0.750000000         0.750000000         0.750000000
     0.000000000         0.000000000         0.000000000
+++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++++
PBS脚本部分
#!/bin/bash
#PBS -N vasp
#PBS -l nodes=1:ppn=36
#PBS -q gentai
cd $PBS_O_WORKDIR
NPROCS=`wc -l < $PBS_NODEFILE`
mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_std
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_ncl
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4/bin/vasp_gam
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_std
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_ncl
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-VTST/bin/vasp_gam
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_std
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_ncl
#mpirun  -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NPROCS  /opt/software/vasp.5.4.4-C/bin/vasp_gam
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1楼 2019-03-31 22:01:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Bachelor.

木虫 (著名写手)
运行的编号.out和.err有什么提示，有35秒证明算了，应该在.out文件里有说明

发自小木虫Android客户端
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2楼2019-03-31 22:07:01
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jmlv

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我估计，作业压根就没开始算。OUTCAR包含哪些内容？
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

悟空pillart
3楼2019-04-01 11:26:38
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悟空pillart

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Bachelor. at 2019-03-31 22:07:01
运行的编号.out和.err有什么提示，有35秒证明算了，应该在.out文件里有说明

好像没有out文件产生，不太懂那个怎么看，我把所有的输出文件已经打包了，如果方便的话麻烦您看一下。
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4楼2019-04-01 11:42:47
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悟空pillart

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jmlv at 2019-04-01 11:26:38
我估计，作业压根就没开始算。OUTCAR包含哪些内容？

对，提交任务后立马输入top都没见vasp在运行，然后输入qstat一直卡在35秒左右，我将所有输出文件打包了，麻烦您给看一下。
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5楼2019-04-01 11:44:50
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悟空pillart

铜虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by jmlv at 2019-04-01 11:26:38
我估计，作业压根就没开始算。OUTCAR包含哪些内容？

OUTCAR里面最下面也没有输出free energy TOTEN和energy without entropy。
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6楼2019-04-01 11:49:03
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wangxuefei11

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
直接用命令跑看看能不能跑起来，如果软件啥的没问题，那估计就你脚本哪有问题，实在不行发tv远程帮你检查下，这种状态基本上就是脚本有问题
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7楼2019-04-01 17:19:06
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jmlv

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by 悟空pillart at 2019-04-01 11:49:03
OUTCAR里面最下面也没有输出free energy TOTEN和energy without entropy。...

好的，我跑跑这个作业看看。
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8楼2019-04-08 10:57:31
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jmlv

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
悟空pillart: 金币+100, ★★★★★最佳答案, 好的，非常感谢，应该是我节点的问题，我回去再试一下。 2019-04-08 13:55:01
引用回帖:
6楼: Originally posted by 悟空pillart at 2019-04-01 11:49:03
OUTCAR里面最下面也没有输出free energy TOTEN和energy without entropy。...

你提供的输入文件，我运行过了，正常结束。输出文件，请见附件。
看来不是输入文件的问题，貌似是你的节点在你使用的时候有一点小问题。
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9楼2019-04-08 13:49:41
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