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15645016370

银虫 (正式写手)

[求助] 求高人指点DFT模拟反应机理已有1人参与

本人想用DFT计算模拟我的反应过程,对于初学者的我来说,有很多不会,老师下达的任务比较紧迫,不求能学的多精,望能有人指点下,协助我算出来,画出能垒图就好,本人将不胜感激,必有重谢!
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15645016370

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-03-23 10:03:58
只是DFT计算的话 那就用高斯就可以。

计算反应机理给出反应路径 是一套计算 需要不少计算方面的知识。

算反应路径基本的思路是对反应路径上的反应物, 各个intermediate和各个TS,和 产物 进行结构优化和振动 ...

您好我想请问一下,优化一个结构,可以同时存在两个过渡态吗?像我这个是两分子果糖的?

发自小木虫IOS客户端
34楼2019-04-15 17:38:36
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15645016370

银虫 (正式写手)

本人邮箱:339320675@qq.com 微信是前面数字
2楼2019-03-23 08:58:26
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
感谢参与,应助指数 +1
15645016370: 金币+10, ★★★很有帮助 2019-03-23 10:22:42
月只蓝: 金币+50, 感谢指导!干货满满! 2019-03-24 14:08:26
只是DFT计算的话 那就用高斯就可以。

计算反应机理给出反应路径 是一套计算 需要不少计算方面的知识。

算反应路径基本的思路是对反应路径上的反应物, 各个intermediate和各个TS,和 产物 进行结构优化和振动频率计算,这样就会得到所有这些结构的能量(E,H 或者 G)。然后就能计算出能垒

所以在算之前需要大概知道这条路径大概是什么样子。然后再针对每个结构进行优化。

要完成一个反应机理的计算最基本的需要知道以下几种类型的高斯的计算方法
1. 几何优化 频率计算 , 关键词是OPT FREQ 这主要针对 反应物 产物 和 intermediate
2. 过渡态结构优化 和频率计算 关键词 OPT=TS  FREQ  
3. IRC 计算,这是用来验证TS是否准确。验证某个TS是否是想要的这条反应路径上的那个TS
4. 柔性扫描 可以帮助你找到过渡态
3楼2019-03-23 10:03:58
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15645016370

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-03-23 10:03:58
只是DFT计算的话 那就用高斯就可以。

计算反应机理给出反应路径 是一套计算 需要不少计算方面的知识。

算反应路径基本的思路是对反应路径上的反应物, 各个intermediate和各个TS,和 产物 进行结构优化和振动 ...

可以指点下计算能垒的具体步骤吗?方便的话加下我的Vx
4楼2019-03-23 11:12:41
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