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水分子模拟已有5人参与
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我现在在做水分子的模拟，但是现在设置初始温度为150，初始速度为400，但是运行不几步之后，水分子的温度就为零了，然后整个系统中的分子都是在非常缓慢的移动，几乎都不动。不知道问题所在，求大神指点 发自小木虫Android客户端 |
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2楼2019-03-20 09:53:57
3楼2019-03-20 10:04:38
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4楼2019-03-20 10:06:18
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5楼2019-03-20 10:06:59
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###########initial setting ########### #fix fixshake1 suan shake 0.0001 5 0 b 1 2 3 4 a 1 2 3 #这一行有问题，要问 fix 10 suan rigid molecule velocity all create 400 49284 timestep 1.0 ############### compute ############# compute 1 Na temp compute 2 Cl temp compute 3 suan temp compute 4 water temp compute 5 all pe compute ake all ke compute energy all group/group suan thermo_style custom step temp c_1 c_2 c_3 thermo 1000 thermo_modify temp 1 fix 1 all nvt temp 300.0 300.0 100.0 fix rec all recenter INIT INIT INIT dump 1 all custom 1000 ch0110.water id type x y z run 1000000 write_data restart.water |
6楼2019-03-20 10:08:25
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7楼2019-03-20 15:07:33
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8楼2019-03-20 22:00:03
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你用的什么单位，timestep设成1.0，而且你的fix nvp的tdamp又是100.0，那频率怕不是1/100年 发自小木虫Android客户端 |
9楼2019-03-21 00:49:49
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10楼2019-03-21 08:46:26