| 查看: 1916 | 回复: 2 | ||
[求助]
lammps超声波模拟设置 已有1人参与
|
|
我的题目是使用lammps模拟超声空化，我把体系分为两部份，一部分为边界区，一部分为主区。通过边界分子的简谐运动来实现超声波的传递进而完成空化过程。但是我在计算了大约20多个简谐运动周期后，主区内的分子依然不动，仅仅是边界区的分子在进行简谐运动。而且出现了 ERROR: Out of range atoms - cannot compute PPPM (src/KSPACE/pppm_tip4p.cpp:106) 这个错误（我是用的是TIP4P水分子）。希望大家能帮助我，这是哪里出了问题呢，应该如何修改，也欢迎各位做超声空化的同僚前来交流，谢谢大家  我的in文件： dimension 3 boundary p p p units real atom_style full read_data b125.data group 1 read_data b2000.data add append group 2 neighbor 2 bin neigh_modify delay 0 every 1 pair_style lj/cut/tip4p/long 1 2 1 1 0.15 8.5 8.5 pair_coeff 1 1 0.1521 3.154000 8.5 pair_coeff * 2 0.000000 0.000000 8.5 bond_style harmonic bond_coeff 1 1000 0.9572 angle_style harmonic angle_coeff 1 3000 104.52 kspace_style pppm/tip4p 0.00001 minimize 1.0e-12 1.0e-12 1000 1000 variable vel equal 0.1*sin(2*PI*0.01*time) fix 1 1 move variable NULL NULL NULL v_vel NULL NULL timestep 0.001 dump 1 all atom 100 dump.lammpstrj run 500000 文件中1即为边界区，2为主区。 |
回复此楼
2楼2019-03-19 09:43:34
3楼2019-04-09 15:09:18
