24小时热门版块排行榜    

查看: 3038  |  回复: 6

lu589

铁虫 (正式写手)

[求助] 高斯扫描 已有1人参与

用高斯做scan,设置了两个扫描变量,都是键长,为什么扫描结果只有一个键长改变,另一个一直保持不变呢,希望各位大佬帮忙解答下
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paramecium86

版主 (著名写手)

把输入和输出文件传上来看看会比较容易看出是怎么回事。
2楼2019-02-28 17:34:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lu589

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-02-28 17:34:33
把输入和输出文件传上来看看会比较容易看出是怎么回事。

您好,这是我的输入和输出文件

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : scan.com
  • 2019-03-03 14:37:07, 4.23 K
  • 附件 2 : scan.log
  • 2019-03-03 14:38:34, 33.87 M
3楼2019-03-03 14:38:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小红豆: 金币+20, 感谢交流 2019-03-04 08:16:10
从输入文件可以看出这是一个双变量各扫描10个值的柔性扫描。当做双变量柔性扫描的时候,高斯计算的顺序是 先让第二个变量取第1个值 保持不变 然后改变第一个变量的值从第1个算到第10个。然后再取第二个变量第2个值保持不变 再依次计算第一个变量的所有的值。依次循环 直到第二个变量所有值都被计算过。  目前这个输出文件中 只有第一个变量改变 而第二个变量一直没变的原因就是  还没计算到第二个变量的第2个值 这个计算就出错停止了。这个分子大 柔性扫描不好算 尤其是算到最远离初始结构的点的时候很容易出问题。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2019-03-03 22:53:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lu589

铁虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-03-03 22:53:43
从输入文件可以看出这是一个双变量各扫描10个值的柔性扫描。当做双变量柔性扫描的时候,高斯计算的顺序是 先让第二个变量取第1个值 保持不变 然后改变第一个变量的值从第1个算到第10个。然后再取第二个变量第2个值保 ...

那您有什么建议么

发自小木虫IOS客户端
5楼2019-03-04 07:58:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

paramecium86

版主 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小红豆: 金币+10, 回帖奖励 2019-03-10 08:00:38
引用回帖:
5楼: Originally posted by lu589 at 2019-03-03 18:58:04
那您有什么建议么
...

如果那三个部分的分子骨架整体变化不大的话 可以试试刚性扫描 也就是用scan命令。不过这时候你就得用内坐标来写分子结构而不能用Cartesian坐标系了。如果想用gaussian自动生成zmatrix的话 那最好是把涉及到扫描的那三个原子的序号挨在一起 要不没法生成想要扫描的变量。

发自小木虫IOS客户端
6楼2019-03-04 08:31:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lu589

铁虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-03-04 08:31:28
如果那三个部分的分子骨架整体变化不大的话 可以试试刚性扫描 也就是用scan命令。不过这时候你就得用内坐标来写分子结构而不能用Cartesian坐标系了。如果想用gaussian自动生成zmatrix的话 那最好是把涉及到扫描的那 ...

好,我试一下,谢谢您
7楼2019-03-04 10:56:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lu589 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料调剂,307分 +8 张泳铭1 2026-03-09 8/400 2026-03-09 20:23 by 雾散后相遇lc
[考研] 数二英二309分请求调剂 +3 dtdxzxx 2026-03-09 4/200 2026-03-09 19:56 by yuningshan
[考研] 348求调剂 +3 wyx79618 2026-03-06 7/350 2026-03-09 16:10 by wyx79618
[考研] 求调剂,数一英一274分 +4 小菲会努力 2026-03-08 4/200 2026-03-09 12:40 by 一定上岸哟_
[考研] 一志愿山东大学105500药学专硕,总分302求调剂 +5 五维天空 2026-03-04 11/550 2026-03-09 09:51 by 五维天空
[考研] 2026考研求调剂-材料类-本科211一志愿985-初试301分 +7 虫友233 2026-03-07 7/350 2026-03-08 22:35 by 小木虫tim
[考研] 考研求调剂,工科,总分304 +4 矮子不想长高了 2026-03-08 7/350 2026-03-08 22:21 by 小木虫tim
[考研] 一志愿哈尔滨工业大学0856材料与化工,前三科206,总分283,求调剂 +7 26考研求调剂 2026-03-06 7/350 2026-03-07 14:49 by Miko19
[考研] 物理学求调剂 +3 sx宋 2026-03-05 3/150 2026-03-07 14:38 by lishahe
[考研] 材料调剂 +10 ounce. 2026-03-04 12/600 2026-03-07 09:14 by Mornach1988
[考研] 085600材料与化工(高分子)290分求调剂 +9 wengyujian 2026-03-04 9/450 2026-03-06 15:59 by 聪明的大松鼠
[考研] 求调剂 +5 danyyyy 2026-03-04 5/250 2026-03-06 08:16 by Leeding1356
[考研] 282求调剂 +7 夕~日 2026-03-05 8/400 2026-03-05 21:31 by zzpnuli111
[考研] 材料调剂 +4 L9370 2026-03-05 4/200 2026-03-05 19:36 by caszguilin
[考研] 材料085600 303求调剂 +7 1bygone 2026-03-04 7/350 2026-03-05 09:39 by oxidpl
[考研] 材料学硕080500复试调剂294 +3 四叶zjz 2026-03-04 3/150 2026-03-05 07:09 by kunm555
[考研] 266求调剂 +7 哇塞王帅 2026-03-03 7/350 2026-03-04 20:30 by 一切OK
[考研] 武理材料工程302调剂 +3 Doleres 2026-03-03 6/300 2026-03-04 15:54 by zhukairuo
[考研] 能动297求调剂,本科川大 +4 邵11 2026-03-04 4/200 2026-03-04 15:29 by lylylyheart
[考研] 化工专硕调剂 +4 利好利好. 2026-03-03 7/350 2026-03-03 21:30 by L135790
信息提示
请填处理意见