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汕头大学海洋科学接受调剂
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lu589

铁虫 (正式写手)

[求助] 高斯扫描 已有1人参与

用高斯做scan，设置了两个扫描变量，都是键长，为什么扫描结果只有一个键长改变，另一个一直保持不变呢，希望各位大佬帮忙解答下
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1楼 2019-02-28 13:18:17
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paramecium86

版主 (著名写手)
把输入和输出文件传上来看看会比较容易看出是怎么回事。
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2楼2019-02-28 17:34:33
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lu589

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-02-28 17:34:33
把输入和输出文件传上来看看会比较容易看出是怎么回事。

您好，这是我的输入和输出文件
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3楼2019-03-03 14:38:40
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paramecium86

版主 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小红豆: 金币+20, 感谢交流 2019-03-04 08:16:10
从输入文件可以看出这是一个双变量各扫描10个值的柔性扫描。当做双变量柔性扫描的时候，高斯计算的顺序是 先让第二个变量取第1个值 保持不变 然后改变第一个变量的值从第1个算到第10个。然后再取第二个变量第2个值保持不变 再依次计算第一个变量的所有的值。依次循环 直到第二个变量所有值都被计算过。  目前这个输出文件中 只有第一个变量改变 而第二个变量一直没变的原因就是  还没计算到第二个变量的第2个值 这个计算就出错停止了。这个分子大 柔性扫描不好算 尤其是算到最远离初始结构的点的时候很容易出问题。
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lu589
4楼2019-03-03 22:53:43
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lu589

铁虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-03-03 22:53:43
从输入文件可以看出这是一个双变量各扫描10个值的柔性扫描。当做双变量柔性扫描的时候，高斯计算的顺序是 先让第二个变量取第1个值 保持不变 然后改变第一个变量的值从第1个算到第10个。然后再取第二个变量第2个值保 ...

那您有什么建议么

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5楼2019-03-04 07:58:04
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paramecium86

版主 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小红豆: 金币+10, 回帖奖励 2019-03-10 08:00:38
引用回帖:
5楼: Originally posted by lu589 at 2019-03-03 18:58:04
那您有什么建议么
...

如果那三个部分的分子骨架整体变化不大的话 可以试试刚性扫描 也就是用scan命令。不过这时候你就得用内坐标来写分子结构而不能用Cartesian坐标系了。如果想用gaussian自动生成zmatrix的话 那最好是把涉及到扫描的那三个原子的序号挨在一起 要不没法生成想要扫描的变量。

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6楼2019-03-04 08:31:28
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lu589

铁虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by paramecium86 at 2019-03-04 08:31:28
如果那三个部分的分子骨架整体变化不大的话 可以试试刚性扫描 也就是用scan命令。不过这时候你就得用内坐标来写分子结构而不能用Cartesian坐标系了。如果想用gaussian自动生成zmatrix的话 那最好是把涉及到扫描的那 ...

好，我试一下，谢谢您
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7楼2019-03-04 10:56:25
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