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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】【求助】非晶的分子动力学模拟
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liangshunx

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】【求助】非晶的分子动力学模拟

刚接触分子模拟，请问多组元非晶的分子动力学模拟用什么软件比较好，如何建模？帮忙推荐学习知料。

[ Last edited by zdhlover on 2009-11-17 at 14:17 ]
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1楼 2009-05-10 10:33:38
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liangshunx

银虫 (小有名气)
MS好像都是计算两个元素的体系，
四组元的非晶体系的模型怎么建立？
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交流合作
3楼2009-05-11 17:17:53
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★
liangshunx(金币+1,VIP+0): 5-12 15:37
MS可以
推荐看看MS的手册 看他的论文列表 也可搜素文献
如K.M.Ho就做了不少
如果体系较大 建议用LAMMPS等开源MD代码
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2楼2009-05-10 12:50:42
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lei0736

荣誉版主 (职业作家)

优秀版主
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
liangshunx(金币+1,VIP+0):有点帮助 5-12 15:30
gwdavid(金币+3,VIP+0):3q 5-15 12:55
gwdavid(金币+3,VIP+0):3q 5-15 12:57
严格说来计算2元都不怎么合理 呵呵
要看你组分如何了 如果有一种是百分之几 那你的计算体系假设只包含一个该类原子总原子数也是几百了 算不动
虽然理论上N元N个原子都可以算
赞一下(21人) 回复此楼
4楼2009-05-11 17:47:06
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老虎大王

木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★
lei0736(金币+4,VIP+0):谢谢 5-12 08:39
liangshunx(金币+1,VIP+0):有点帮助 5-12 15:30
多元很难搞的。不是程序的问题，而是势函数的问题。三元以上，势函数的建立就相当之麻烦了。
如果你有势函数，那么模拟计算过程并不比单元系或二元系更复杂。不过模拟完了之后，麻烦就会来了，因为组元多，数据的处理也够你喝一壶的。
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5楼2009-05-11 20:25:43
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