应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » EMSA/ChIP » ChIP-qPCR引物设计
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
41/1返回列表
查看: 3888  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

Lucasssssss

新虫 (小有名气)

[交流] ChIP-qPCR引物设计

从没接触过ChIP…很想知道transcriptional factor知道之后，怎么去设计引物…

发自小木虫IOS客户端
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2019-02-26 08:26:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

土豆君

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-02-26 22:14:13
根据你研究的TF的下游靶基因，在它的promotor区设计多段引物，body区也可以设计一对作为参照。
当然，如果在promotor区发现TF的motif，引物根据motif设计更好。
赞一下 回复此楼
爱基百客，提供专业级ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq、RIP-seq等表观技术服务
2楼2019-02-26 09:19:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Lucasssssss

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 土豆君 at 2019-02-26 09:19:12
根据你研究的TF的下游靶基因，在它的promotor区设计多段引物，body区也可以设计一对作为参照。
当然，如果在promotor区发现TF的motif，引物根据motif设计更好。

找到motif之后，怎么去设计引物？
我在eukaryotic promoter database找到了我要的那个TF那段的motif，然后怎么去设计这个引物？比如这个motif的位点在-700bp，那么引物设计改怎么去弄？
小白完全不会

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
3楼2019-02-26 21:28:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

猪妹妹May

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by Lucasssssss at 2019-02-26 21:28:46
找到motif之后，怎么去设计引物？
我在eukaryotic promoter database找到了我要的那个TF那段的motif，然后怎么去设计这个引物？比如这个motif的位点在-700bp，那么引物设计改怎么去弄？
小白完全不会
...

您好！我做的chip之前别人做过，我依据他的peak在TSS前后两千bp都设计了qpcr引物，但很疑惑为什么数据库里的chip数据在TSS后（body区？）也有peak。不知道我这么设计对不对……
赞一下 回复此楼
4楼2020-05-25 00:09:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Lucasssssss 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 【求调剂】085601材料工程专硕 | 总分272 | +5 脚滑的守法公民 2026-03-27 5/250 2026-03-27 22:50 by lcl13500..
[考研] 265求调剂 +8 小木虫085600 2026-03-27 8/400 2026-03-27 22:16 by 无际的草原
[考研] 266分，求材料冶金能源化工等调剂 +5 哇呼哼呼哼 2026-03-27 7/350 2026-03-27 21:41 by lbsjt
[考研] 283求调剂（080500） +4 A child 2026-03-27 4/200 2026-03-27 15:34 by XPU李庆
[考研] 311求调剂 +7 lin0039 2026-03-26 7/350 2026-03-27 12:42 by 果果妈咪
[考研] 22408 359分调剂 +3 Qshers 2026-03-27 3/150 2026-03-27 12:22 by wxiongid
[考研] 329求调剂 +4 星野? 2026-03-26 4/200 2026-03-27 12:00 by 不吃魚的貓
[考研] 333求调剂 +3 question挽风 2026-03-23 3/150 2026-03-27 11:29 by 不吃魚的貓
[考研] 0703化学/290求调剂/本科经历丰富/工科也可 +7 丹青奶盖 2026-03-26 8/400 2026-03-27 11:24 by 丹青奶盖
[考研] 一志愿郑州大学，080500学硕，总分317分求调剂 +4 举个栗子oi 2026-03-24 5/250 2026-03-26 23:15 by 不吃魚的貓
[考研] 085602 289分求调剂 +8 WWW西西弗斯 2026-03-24 8/400 2026-03-26 16:33 by 不吃魚的貓
[考研] 281求调剂 +6 Koxui 2026-03-24 7/350 2026-03-26 15:37 by 无际的草原
[考研] 一志愿哈工大，085400，320，求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 一志愿吉林大学材料与化工303分求调剂 +4 为学666 2026-03-24 4/200 2026-03-25 11:27 by BruceLiu320
[考研] 086003食品工程求调剂 +6 淼淼111 2026-03-24 6/300 2026-03-25 10:29 by 3Strings
[考研] 0703化学调剂，求导师收 +7 天天好运来上岸� 2026-03-24 7/350 2026-03-24 20:26 by peike
[考研] 一志愿北化315 求调剂 +3 akrrain 2026-03-24 3/150 2026-03-24 19:35 by 了了了了。。
[考研] 080500求调剂 +3 zzzzfan 2026-03-24 3/150 2026-03-24 16:38 by barlinike
[考研] 求调剂院校信息 +6 CX 330 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:25 by 无懈可击111
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭