应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » EMSA/ChIP » ChIP-qPCR引物设计
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
41/1返回列表
查看: 3890  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

Lucasssssss

新虫 (小有名气)

[交流] ChIP-qPCR引物设计

从没接触过ChIP…很想知道transcriptional factor知道之后，怎么去设计引物…

发自小木虫IOS客户端
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2019-02-26 08:26:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

土豆君

银虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-02-26 22:14:13
根据你研究的TF的下游靶基因，在它的promotor区设计多段引物，body区也可以设计一对作为参照。
当然，如果在promotor区发现TF的motif，引物根据motif设计更好。
赞一下 回复此楼
爱基百客，提供专业级ChIP-seq、ATAC-seq、MeRIP-seq、RIP-seq等表观技术服务
2楼2019-02-26 09:19:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Lucasssssss

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 土豆君 at 2019-02-26 09:19:12
根据你研究的TF的下游靶基因，在它的promotor区设计多段引物，body区也可以设计一对作为参照。
当然，如果在promotor区发现TF的motif，引物根据motif设计更好。

找到motif之后，怎么去设计引物？
我在eukaryotic promoter database找到了我要的那个TF那段的motif，然后怎么去设计这个引物？比如这个motif的位点在-700bp，那么引物设计改怎么去弄？
小白完全不会

发自小木虫IOS客户端
赞一下 回复此楼
3楼2019-02-26 21:28:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

猪妹妹May

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by Lucasssssss at 2019-02-26 21:28:46
找到motif之后，怎么去设计引物？
我在eukaryotic promoter database找到了我要的那个TF那段的motif，然后怎么去设计这个引物？比如这个motif的位点在-700bp，那么引物设计改怎么去弄？
小白完全不会
...

您好！我做的chip之前别人做过，我依据他的peak在TSS前后两千bp都设计了qpcr引物，但很疑惑为什么数据库里的chip数据在TSS后（body区？）也有peak。不知道我这么设计对不对……
赞一下 回复此楼
4楼2020-05-25 00:09:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Lucasssssss 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 331环境科学与工程求调剂 +3 熠然好运气 2026-03-27 3/150 2026-03-28 04:11 by fmesaito
[有机交流] 高温高压反应求助 10+4 chibby 2026-03-25 4/200 2026-03-27 21:08 by BT20230424
[考研] 070300求调剂306分 +3 26要上岸 2026-03-27 3/150 2026-03-27 17:57 by arrow8852
[考研] 085601 材料工程 313分 求调剂 +5 Ong3 2026-03-27 5/250 2026-03-27 12:24 by goldfish51
[考研] 341求调剂 +7 青柠檬1 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:19 by wxiongid
[考研] 333求调剂 +6 wfh030413@ 2026-03-23 6/300 2026-03-26 22:45 by 学员8dgXkO
[考研] 086000生物与医药292求调剂 +6 小小陈小小 2026-03-22 9/450 2026-03-26 15:58 by dick_runner
[考研] 一志愿 南京邮电大学 288分 材料考研 求调剂 +3 jl0720 2026-03-26 3/150 2026-03-26 13:39 by zzll406
[考研] 085600 材料与化工 329分求调剂 +9 Mr. Z 2026-03-25 9/450 2026-03-26 10:36 by baoball
[考研] 07化学303求调剂 +5 睿08 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:46 by 418490947
[考研] 机械学硕总分317求调剂！！！！ +4 Acaciad 2026-03-25 4/200 2026-03-25 19:59 by hanserlol
[考研] 26考研-291分-厦门大学（085601）-柔性电子学院材料工程专业求调剂 +3 min3 2026-03-24 4/200 2026-03-25 18:22 by xcjcqu
[考研] 0703化学求调剂 +6 奶油草莓. 2026-03-22 7/350 2026-03-25 10:00 by shangxh
[考研] 318求调剂 +3 plum李子 2026-03-23 3/150 2026-03-25 09:42 by 雾散后相遇lc
[考研] 材料专硕找调剂 +5 哈哈哈吼吼吼哈 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:07 by 了了了了。。
[考研] 341求调剂(一志愿湖南大学070300) +5 番茄头--- 2026-03-22 6/300 2026-03-23 23:45 by Txy@872106
[考研] 070300，一志愿北航320求调剂 +3 Jerry0216 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:16 by 。。堂堂
[考研] 308求调剂 +3 墨墨漠 2026-03-21 3/150 2026-03-22 16:54 by i_cooler
[考研] 求调剂院校信息 +6 CX 330 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:25 by 无懈可击111
[考研] 求助 +5 梦里的无言 2026-03-21 6/300 2026-03-21 17:51 by 学员8dgXkO
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭