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JM109

新虫 (初入文坛)

[交流] 双质粒系统的knock-in载体donorDNA区构建已有2人参与

有没有经常做酶切连接的大神来看一看。
knockout和knockin两个载体同时在构建。
knockout是将目的基因上下游同源臂A,B通过overlap pcr连在一起,然后酶切连接到载体上。
knockin是在上述基础上在上下游同源臂A,B之间再加入一段有功能的基因,是3个片段的overlap pcr产物。
然而,两个片段的很容易就连上载体了,但是加入一段基因后,-同源臂A-基因-同源臂B- 这个片段死活连不上载体,很头疼不知道哪里出了问题。
out和in两端保护碱基都是一样的,连接的载体骨架也是一样的,酶切位点都是EcoR1和Hind3,片段双酶切过夜完胶回收然后再跑电泳条带都是大小正确且单一的。然后t4 16度连4h转化感受态。转化平板一般都不长或者长得慢挑出来验证都不是。

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新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你好,请问你是要在人类AAVS1做基因敲入吗?请问你选择的什么donor质粒?

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2楼2019-05-22 23:34:07
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眺望爱

铜虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
首先,我很想知道你三个片段overlap产物怎么来的??问题可能就出在这里啦,你想啊,正反一对引物,恰好可以结合起来还有俩粘性末端,那三个正反正?但是你首尾是反的啊!所以要至少四条,正反正反才可以实现。不然你的三条产物就只有正反,最后一个还是反的结合不了,也就没有合适的粘性末端啦。当然也不会成功。

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目标:生物的星辰大海!!!!
3楼2019-05-30 16:46:08
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