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Cherishqj

铜虫 (小有名气)

[求助] 关于同源臂 已有2人参与

本人在学习基因敲除的相关知识,看到论文中提到了同源臂,请问同源臂是根据什么序列设计引物来合成的,举个例子,待敲除基因为ATGCTTACCATGCCGGACGTCATCGTCAAAAATCAGAGCGAGCTTGATGC·············TACCGCATGGAATTGTTGCACCACGTCTGA,是根据粗体部分设计引物还是需要知道待敲除基因两侧的序列才能设计
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Cherishqj

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Eternity宇 at 2019-02-09 16:29:42
很多,比如Takara的In-fusion酶界面上就有在线的设计工具

谢谢您的回复,请问同源臂在靶基因前后之外的区域吗
3楼2019-02-09 19:14:32
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Eternity宇

禁虫 (著名写手)


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2019-02-13 20:30:09
本帖内容被屏蔽

2楼2019-02-09 16:29:42
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Eternity宇

禁虫 (著名写手)

本帖内容被屏蔽

4楼2019-02-09 22:23:00
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Cherishqj

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by Eternity宇 at 2019-02-09 22:23:00
其实就是两侧的序列
...

也就是说同源臂并不是待敲除基因的一部分,而是其前侧和后侧的一段对吗?我看了一篇中文文献,在这个截图里ATG和TAA是待敲除基因的起始密码子和终止密码子,而划线部分是同源臂,这是为什么呢,同源臂的设计到底能不能和待敲除基因重叠呢?
5楼2019-02-10 12:25:18
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