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socchu

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】输入原子坐标比例不对

求助:

    我是刚用CASTEP的新手,现在遇到了一个问题,希望好心人能帮忙解答一下:

    我想计算BaCO3结构,但是建立晶胞,输入FIndit里面记录的原子坐标后,发现symmetry system 里显示的原子数比例不符合Ba:C:O=1:1:3关系,
请问这是否意味着原子坐标是错误的?能否利用这个结构计算BaCO3的结构?
请帮助解答,多谢!
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socchu

金虫 (正式写手)

BaCO3归属于45-1471相,在Findit中可以找到两种对应的结构,分别是
1:The structure has been assigned a PDF number: 45-1471
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H
Ba   1  +2    4 c   0.25        0.41631(5)  0.7549(2)      1.         0   
C    1  +4    4 c   0.25        0.7570(12)  -.0810(26)     1.         0   
O    1  -2    4 c   0.25        0.9011(8)   -.0878(19)     1.         0   
O    2  -2    8 d   0.4595(10)  0.6839(6)   -.0790(14)     1.         0   
Vol         303.81
Z           4
Space Group P m c n
SG Number   62
Cryst Sys   orthorhombic
Pearson     oP20

2:Comments    Compound with mineral name: Witherite
            The structure has been assigned a PDF number: 45-1471
            Calculated density unusual but tolerable.
            No R value given in the paper.
            At least one temperature factor missing in the paper.
Atom  #   OX   SITE      x           y           z           SOF      H
Ba   1  +2    4 c   0.25        0.417       0.252          1.         0   
C    1  +4    4 c   0.25        0.75        0.405          1.         0   
O    1  -2    4 c   0.25        0.889       0.405          1.         0   
O    2  -2    8 d   0.452       0.68        0.405          1.         0   
Vol         303.84
Z           4
Space Group P m c n
SG Number   62
Cryst Sys   orthorhombic

我就是按照这两种结构去尝试,结果输入进去建模后所显示的比例都不对!
不知道是不是Findit中的原子坐标是错误的还是其他的原因,??
很是困惑!!!
6楼2009-05-07 11:51:36
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Minicheung

至尊木虫 (职业作家)


wuchenwf(金币+1):谢谢
不会吧,
先搞清BaCO3的结构,和各个原子的位置,利用分数坐标,不是很好建模吗?

原子坐标是否错误,这个可以自己验证的啊
2楼2009-05-06 20:20:12
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socchu

金虫 (正式写手)

那个FIndit中的原子坐标输入进去为什么比例不对啊?

怎么用分数坐标建模??

望指点!
3楼2009-05-06 20:46:06
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socchu

金虫 (正式写手)

建模就是先选好空间群和晶体结构,输入晶胞参数,然后输入FIndit对应的原子坐标,是这样的么??为什么我这样操作后得到的结构比例不对呢??
4楼2009-05-06 20:50:46
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