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simpsonx

铜虫 (小有名气)

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专业: 生物地球化学

[交流] 【求助】胶体对小分子的吸附可以用哪些软件做模拟？

完全是新手，对模拟很感兴趣。
不知能否用计算机模拟胶体颗粒对小分子的吸附，计算吸附自由能、焓变和熵变，或者探讨两者间可能的化学键？有哪些软件可以得到这些全部或部分信息？请不吝赐教，谢谢！

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 11:58 ]

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1楼2009-05-06 14:51:55

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bay__gulf

金虫 (著名写手)

刘苏州

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管辖: 分子模拟

★ ★
xuefei06(金币+2,VIP+0):3Q！ 5-7 09:47

粗粒化MD(coarse graining MD,CGMD)相对于全原子MD而言，是把一个原子集团看做一个质点，通过定义集团间的相互作用和求解体系的运动方程的形式，得到体系的演化趋势，并且通过各种物理量的统计得到体系的宏观性质。
DPD是更彻底的粗粒化。

用全原子MD不是不可以，但对于胶束这种大型体系，非常耗费资源，结果也不一定好。

可以实现CGMD的软件有gmx，namd等