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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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angeltong

木虫 (正式写手)

[求助] 关于RDF得到的曲线都是锯齿怎么解决呢? 已有2人参与

我最近在用MS软件跑MD,得到的结果计算RDF时候曲线都是锯齿,峰一点也不平滑,请问各位大神这是哪里出了问题呢?本人MS小白,请多指教。
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xinzhi

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
曲线锯齿形,说明平均的数据点太少,可以使用多个frame求平均,另外如何体系小那么模拟的时间应该足够长,轨线存储的间隔应小一些以保证足够的点来平均。

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3楼2019-01-18 16:13:59
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jluchemlib

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用轨迹文件的多个frame求平均

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2019-01-18 09:08:10
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angeltong

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jluchemlib at 2019-01-18 09:08:10
用轨迹文件的多个frame求平均

轨迹文件那里是all,请问怎么求平均呢?本人小白,请指教!
4楼2019-01-31 16:51:52
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angeltong

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by xinzhi at 2019-01-18 16:13:59
曲线锯齿形,说明平均的数据点太少,可以使用多个frame求平均,另外如何体系小那么模拟的时间应该足够长,轨线存储的间隔应小一些以保证足够的点来平均。

请问轨迹存储时间是指frame output every:steps这里吗?我用的就是默认值5000,小一些一般可以改到多少呢?
5楼2019-01-31 16:54:28
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