24小时热门版块排行榜    

查看: 2463  |  回复: 5

angeltong

木虫 (正式写手)

[求助] 关于RDF得到的曲线都是锯齿怎么解决呢? 已有2人参与

我最近在用MS软件跑MD,得到的结果计算RDF时候曲线都是锯齿,峰一点也不平滑,请问各位大神这是哪里出了问题呢?本人MS小白,请多指教。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jluchemlib

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用轨迹文件的多个frame求平均

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2019-01-18 09:08:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xinzhi

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
曲线锯齿形,说明平均的数据点太少,可以使用多个frame求平均,另外如何体系小那么模拟的时间应该足够长,轨线存储的间隔应小一些以保证足够的点来平均。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2019-01-18 16:13:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

angeltong

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by jluchemlib at 2019-01-18 09:08:10
用轨迹文件的多个frame求平均

轨迹文件那里是all,请问怎么求平均呢?本人小白,请指教!
4楼2019-01-31 16:51:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

angeltong

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by xinzhi at 2019-01-18 16:13:59
曲线锯齿形,说明平均的数据点太少,可以使用多个frame求平均,另外如何体系小那么模拟的时间应该足够长,轨线存储的间隔应小一些以保证足够的点来平均。

请问轨迹存储时间是指frame output every:steps这里吗?我用的就是默认值5000,小一些一般可以改到多少呢?
5楼2019-01-31 16:54:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xinzhi

至尊木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by angeltong at 2019-01-31 16:54:28
请问轨迹存储时间是指frame output every:steps这里吗?我用的就是默认值5000,小一些一般可以改到多少呢?...

5000可以改为500,或50,根据实际情况定。

发自小木虫Android客户端
6楼2019-02-01 07:35:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 angeltong 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 某些机构,以效率低为荣,以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 有没有大神帮我看看基金代码 28+3 1234567wang 2026-08-24 9/450 2026-08-25 16:51 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 18/900 2026-08-25 14:50 by Weed114114
[基金申请] 什么时候开奖? +12 CrisMessi 2026-08-18 13/650 2026-08-25 14:40 by ZJTJZ
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +7 炎黄贵胄 2026-08-22 8/400 2026-08-25 08:48 by ZJTJZ
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见