查看: 1597  |  回复: 15
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

943886740

新虫 (小有名气)

[交流] 关于建立amorphous cell的密度问题已有2人参与

看文献就是NPT、NVT 来回动力学模拟实现密度的还原。我想请教一下,下面的at the relaxed density该如何实现,是直接用前面动力学模拟生成的晶胞进行运算吗?还是有其他的操作呢?
Accomplishment of MD simulation with NVT ensemble at 298.15 K was done at the relaxed density for 3 ns employing cell multipole method (CMM).
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

943886740

新虫 (小有名气)

引用回帖:
12楼: Originally posted by lzq_buct at 2019-01-18 08:37:24
下午我给你贴个图,做模拟时候每多少步会有一个帧输出。要选用最后一帧作为第二阶段的模拟初始构象

好的  谢谢啦

发自小木虫Android客户端
13楼2019-01-18 15:58:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

匿名

用户注销 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖仅楼主可见
2楼2019-01-15 17:31:49
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

943886740

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 天大化工 at 2019-01-15 17:31:49
应该就是先npt模拟

因为我之前用的是逐渐加压多次NPT模拟,发现每次都是从初始密度开始模拟。文献里的在松弛状态下的密度进行NVT怎么实现呢?现在搞不太懂。
3楼2019-01-15 18:27:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

匿名

用户注销 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖仅楼主可见
4楼2019-01-15 21:23:26
已阅   申请模拟EPI   回复此楼   编辑   查看我的主页
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] Pattern Recognition期刊,二审审稿邀请发出一个月了,但有一个审稿人一直未接受审稿 5+3 PLVS_VLTRA 2024-06-19 5/250 2024-06-20 22:54 by holypower
[基金申请] 江苏省333人才工程 出校后被刷的概率大不大? +4 maxbirdzhang 2024-06-19 4/200 2024-06-20 22:38 by sunss
[基金申请] 工材口青年基金上会可能性 +9 今晚推荐22 2024-06-19 11/550 2024-06-20 22:30 by andywei1028
[找工作] 初始合伙人来啦!(生物试剂耗材标准品) +16 欢快的小科研人 2024-06-15 27/1350 2024-06-20 22:19 by zzw1992127
[基金申请] 江南大学到瑞士招聘,称取消非升即走,改预聘+长聘 +21 babu2015 2024-06-18 23/1150 2024-06-20 18:25 by zpv2011
[论文投稿] 求机械类四区sci推荐 5+4 迷茫小旷 2024-06-14 7/350 2024-06-20 17:42 by 不一样烟火12345
[基金申请] 青年基金会评专家到底是怎么会评的呀?主审专家是不是一般不会改动系统按函评给的顺序 5+4 他山攻玉之石 2024-06-18 18/900 2024-06-20 16:33 by 他山攻玉之石
[找工作] 高校两个offer选择 +15 cowox2021 2024-06-18 16/800 2024-06-20 15:24 by ase123456
[硕博家园] 豫北虫友互识 +11 xuhongli903 2024-06-18 12/600 2024-06-20 13:32 by 1429524838
[精细化工] 切削液交流群 +5 SZ吴彦祖 2024-06-17 5/250 2024-06-20 12:10 by 毛爱波BBB
[基金申请] 面青地会评时间??? +7 Axvdvbfs 2024-06-19 8/400 2024-06-20 11:16 by 路遥还有谁
[考博] 关于读博感觉自己很抓马 +9 小九月 2024-06-19 12/600 2024-06-20 11:06 by SCITOPPP
[论文投稿] Scientific Reports二审90天了,催稿也没反应怎么办? +3 智晨君 2024-06-18 6/300 2024-06-19 20:08 by licheng78
[基金申请] F口信息学部拿面上,大概需要什么样的成果 +7 _奋黎_ 2024-06-16 18/900 2024-06-19 20:02 by _奋黎_
[基金申请] Nature 11日发文,中国著名学者们称造假迫不得已 +8 babu2015 2024-06-14 8/400 2024-06-19 15:25 by 风今25
[基金申请] 博后基金刷到的BUG,图片来的更直观 +15 carolloo 2024-06-17 16/800 2024-06-19 09:42 by msjy
[高分子] 寻找聚酯反应釜 +3 茕茕恭煮 2024-06-15 6/300 2024-06-18 14:15 by 茕茕恭煮
[基金申请] 有人中过人文社科类的博后特助吗? +3 outsider1986 2024-06-16 5/250 2024-06-18 11:10 by 袁天未然
[论文投稿] 投稿被一个审稿人恶意评审了怎么样? +5 1chen 2024-06-14 7/350 2024-06-15 23:15 by xy66xy
[基金申请] 博后基金,以往的结果点不开,怎么回事呢?最后一次机会了,两次都没中前面。 +7 kyukitu 2024-06-14 13/650 2024-06-15 06:46 by 我是王小帅
信息提示
请填处理意见