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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 有没有这样一种分子对接的软件？？？
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药剂小学生

新虫 (小有名气)

[交流] 有没有这样一种分子对接的软件？？？ 已有3人参与

有没有这样的一种软件，可以模拟已经的酶，和自己设计的多肽的反应情况？

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1楼 2019-01-11 23:21:35
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magicdalang

新虫 (小有名气)
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对接可以做，对接后在做分子动力学

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2楼2019-01-12 00:37:43
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药剂小学生

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by magicdalang at 2019-01-12 00:37:43
对接可以做，对接后在做分子动力学

是分子对接嘛？分子动力学用什么做呢？还有怎么根据已经的酶设计多肽底物呢？

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3楼2019-01-12 09:43:16
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longdlut

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★
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分子对接autodock，分子动力学gromacs

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4楼2019-01-12 14:59:38
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一代米哟

新虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
分子对接推荐用UCSF DOCK6，动力学用Amber或gromacs，可以百度搜索一下【蛋白/核酸/多肽-小分子对接(DOCK6)】和【分子动力学教程 分子动力学模拟（Amber 20）】，用浏览器访问，联网即可，不用安装软件，对个人电脑配置没有要求（注：动力学往往要在高性能计算集群中计算，用到GPU，一般个人电脑远远达不到这样的性能）。
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5楼2021-12-09 15:49:04
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