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药剂小学生

新虫 (小有名气)

[交流] 有没有这样一种分子对接的软件???已有3人参与

有没有这样的一种软件,可以模拟已经的酶,和自己设计的多肽的反应情况?

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magicdalang

新虫 (小有名气)


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对接可以做,对接后在做分子动力学

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2楼2019-01-12 00:37:43
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药剂小学生

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by magicdalang at 2019-01-12 00:37:43
对接可以做,对接后在做分子动力学

是分子对接嘛?分子动力学用什么做呢?还有怎么根据已经的酶设计多肽底物呢?

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3楼2019-01-12 09:43:16
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longdlut

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分子对接autodock,分子动力学gromacs

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4楼2019-01-12 14:59:38
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一代米哟

新虫 (小有名气)


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分子对接推荐用UCSF DOCK6,动力学用Amber或gromacs,可以百度搜索一下【蛋白/核酸/多肽-小分子对接(DOCK6)】和【分子动力学教程 分子动力学模拟(Amber 20)】,用浏览器访问,联网即可,不用安装软件,对个人电脑配置没有要求(注:动力学往往要在高性能计算集群中计算,用到GPU,一般个人电脑远远达不到这样的性能)。
5楼2021-12-09 15:49:04
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