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d1scovery

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问有没有做过16S rRNA和ITS测序的学长或学姐? 已有2人参与

第一次搞这个东西,有很多问题,例如样品送去测序之前需要预处理吗?还有就是测序完之后,需不需要在电脑上下载一些数据分析的软件呢?我导师就带我一个研究生,没人问,哎只能发帖,老师什么都让自己弄,没办法,神烦,求大神指导一波。
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喜自然果冻

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

样本制备好就ok了,其他都有可以外包
4楼2019-01-26 10:48:23
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GRUBBY_WU

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+4, 鼓励回帖交流 2019-01-12 09:55:15
16S与ITS分别是做细菌与真菌多样性研究用,比如肠道菌群、环境宏基因组、环境微生物等

样品准备的话,环境样品有一些现成试剂盒,比如土壤、粪便等等,甚至可以找外包公司做,都会给你详细的样品准备要求

测序分析的话,如果不是生信分析专业,建议把更多的时间花费在课题前期的实验调研、设计与实验方面

生信分析的话,首先要掌握Linux系统,至少会一种编程语言像perl、java、python,和画图的R语言
2019更好更棒!
2楼2019-01-10 21:19:05
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GRUBBY_WU

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-01-12 09:55:27
在补充一些,可以在一些高通量测序公司网站里找微生物测序-16S/18S/ITS,里面都会详细解释每种测序目的,研究策略、技术路线与思路、个性化需求、案例分析等,可以做对比几家就基本知道这个是做什么以及怎么做。好像不能上传图片
2019更好更棒!
3楼2019-01-10 21:28:48
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