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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 请问有没有做过16S rRNA和ITS测序的学长或学姐？
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d1scovery

新虫 (初入文坛)

[求助] 请问有没有做过16S rRNA和ITS测序的学长或学姐？ 已有2人参与

第一次搞这个东西，有很多问题，例如样品送去测序之前需要预处理吗？还有就是测序完之后，需不需要在电脑上下载一些数据分析的软件呢？我导师就带我一个研究生，没人问，哎只能发帖，老师什么都让自己弄，没办法，神烦，求大神指导一波。
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1楼 2019-01-08 17:23:34
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GRUBBY_WU

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+4, 鼓励回帖交流 2019-01-12 09:55:15
16S与ITS分别是做细菌与真菌多样性研究用，比如肠道菌群、环境宏基因组、环境微生物等

样品准备的话，环境样品有一些现成试剂盒，比如土壤、粪便等等，甚至可以找外包公司做，都会给你详细的样品准备要求

测序分析的话，如果不是生信分析专业，建议把更多的时间花费在课题前期的实验调研、设计与实验方面

生信分析的话，首先要掌握Linux系统，至少会一种编程语言像perl、java、python，和画图的R语言
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2019更好更棒!
2楼2019-01-10 21:19:05
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GRUBBY_WU

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2019-01-12 09:55:27
在补充一些，可以在一些高通量测序公司网站里找微生物测序-16S/18S/ITS，里面都会详细解释每种测序目的，研究策略、技术路线与思路、个性化需求、案例分析等，可以做对比几家就基本知道这个是做什么以及怎么做。好像不能上传图片
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2019更好更棒!
3楼2019-01-10 21:28:48
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喜自然果冻

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

样本制备好就ok了，其他都有可以外包
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4楼2019-01-26 10:48:23
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