| 查看: 1721 | 回复: 3 | ||
[求助]
求助师兄师姐，我怎么找要求基因然后下载并知道这些基因的关系并构建网络呢？ 已有1人参与
|
|
建立基因调控网络(GRN) 在本工作中，使用来自以下Web服务器的公共可用基因表达数据构建模型GRN： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/ 从Homo sapiens中提取数据集，列出5个高表达基因和5个弱表达基因。确定这10个基因之间的相关性。 从Mus musculus中获取第二个数据集，然后列出步骤1中发现的10个基因。确定这10个基因之间的相关性。 注：使用“cytoscape”确定网络，并对两个小网络进行比较。 要求：简要介绍每种基因的功能。 发自小木虫Android客户端 |
回复此楼» 猜你喜欢
含氟糖皮质激素的外用抗炎利器醋酸氟轻松
已经有0人回复
-
阿莫奈韦（Amenamevir）：解旋酶-引物酶靶向分子的结构特征与合成路径全解析
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有284人回复
-
利瑞鲁单抗：靶向KIR的NK细胞检查点工具抗体，结构基础与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Wnt-C59：PORCN靶向化学探针，Wnt信号通路阻断机制与科研应用全解析
已经有0人回复
-
Fexaramine：肠道限制性FXR化学探针，结构特征与信号通路研究全解析
已经有0人回复
-
NVS-STG2：靶向STING跨膜域的分子胶类激动剂，结构特征与寡聚化机制研究全解析
已经有0人回复
-
DOTA-GPC3肽（CAS 3066439-94-6）：双功能分子探针前体的结构特征与标记应用解析
已经有0人回复
-
科研用 TLR7/8 双激动剂怎么选？现货与质控要点
已经有0人回复
-
SEL120-34A HCl：CDK8/CDK19高选择性激酶抑制剂
已经有0人回复
随风入墨
新虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 2034.3
- 散金: 160
- 红花: 1
- 沙发: 2
- 帖子: 546
- 在线: 13.7小时
- 虫号: 8557223
- 注册: 2018-04-18
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
2楼2019-01-06 19:23:02
 本帖仅楼主可见 |
3楼2019-01-06 21:33:32
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
西门吹雪170: 金币+5, 鼓励热心回帖交流 2019-02-25 22:00:43
西门吹雪170: 金币+5, 鼓励热心回帖交流 2019-02-25 22:00:43
| 可以把数据做完功能分析再导入cytoscape里面作图，关键是前面的数据有找完并分析好了吗？前期对于GEO数据库的搜索和挖掘一般要自己先定好标准，然后根据筛选要求选取自己需要的数据集，然后做一系列的数据指控，功能分析等等。如果数据已经找完的话，也会敲一点点代码，那么可以尝试用R包来进行分析，网上教程非常多的。如果不太会敲代码，那么只能用网络上的一些在线分析软件了，我之前用过omicsshare，小工具分的比较细致，可以更具需求来使用。还用过一个叫omicsbean的，这个里面整合了cytoscape的做图功能，前期也可以转化GEO的数据库。就是用起来之前需要看一下操作教程，不然不知道怎么点，操作教程有的还看不太懂的话就打他们电话去问就行，技术支持还可以，希望对你有帮助 |
4楼2019-02-25 09:07:36
