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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 双酶切连接测序结果比对连入了其他的一段莫名其妙的序列，求其原因谢谢
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tailixin

新虫 (小有名气)

[求助] 双酶切连接测序结果比对连入了其他的一段莫名其妙的序列，求其原因谢谢

做一个很简单的双酶切后载体与片段连接的实验，但测序结果回来在两个选定酶切位点之间总是BLAST出其他的序列，根本不是我的目的片段，空载体也测序了没有问题，片段是双酶切胶回收的，大小也正确，很奇怪，各位大佬帮忙分析有什么原因呗！
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1楼 2018-12-12 15:40:36
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Esther_Young

铜虫 (小有名气)
我当时也有过这种情况 800bp的目的基因在300bp左右的位置上多了50个bp 但是重新挑菌提质粒测序就没事了

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10楼2019-03-03 02:17:27
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渊博震天

版主 (职业作家)

Yeast Display

优秀版主优秀版主
莫名奇妙的基因比对结果呢？是不是操作污染了
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2楼2018-12-12 17:22:24
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tailixin

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 渊博震天 at 2018-12-12 17:22:24
莫名奇妙的基因比对结果呢？是不是操作污染了

插入了100bp左右片段，其中30多bp比对是果蝇或者其他序列，没有参考价值，剩下根本没有相似的基因

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3楼2018-12-12 17:50:20
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tailixin

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 渊博震天 at 2018-12-12 17:22:24
莫名奇妙的基因比对结果呢？是不是操作污染了

而且做了三次都是差不多，会是感受态原因吗

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4楼2018-12-12 17:51:40
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