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鲁智深的皮

铁虫 (小有名气)

[求助] 请教VMD中的AutoPSF功能

大佬们,我的粗粒化模型的pdb文件在用AutoPSF生成psf的时候chain的数量变多了怎么回事,原本只有169条链,现在变成了253条链,而且segment的名字也给我改了。。。请问有什么可以不修改chain数量的方法自动生成psf吗

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peng660

新虫 (小有名气)

参考tutorial,用脚本做,细节就清楚了

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2楼2018-12-08 21:19:15
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鲁智深的皮

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by peng660 at 2018-12-08 21:19:15
参考tutorial,用脚本做,细节就清楚了

我是参考tutorial做的,Autopsf这个插件用不到脚本呀

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3楼2018-12-09 14:53:37
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鲁智深的皮

铁虫 (小有名气)

我已经找到解决办法了,就是得自己添加链,不能用插件里的guess and split chains,这个可能切的不准确

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4楼2018-12-09 16:29:25
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