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兮西熙

新虫 (初入文坛)

[求助] 构建载体一直不成功 已有1人参与

想把目的基因a连在环状载体上,一直构不成功
基因大小2.7kb
说明一下,pcr产物验证没问题,酶切位点选择也核对过没有问题,37度双酶切过夜,胶回收。酶连体系,基因与载体1:5-10都试过,4度过夜连和常温下1-4小时都试过,感受态公司制备,
转化后涂LA平板,长出的单克隆有50个左右.菌落pcr鉴定,通用引物上游加目的基因下游,只有3个有条带,送测序,测序结果不对
还有一种情况是通用引物上游加目的基因下游,无条带,用目的基因的上下游进行菌p验证,用目的基因片段作正对照,有10个左右有条带,提质粒送测序,结果还是不对
已经构了很长时间了,一直不成功,相当迷茫
,希望能有人能指点一下

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GRUBBY_WU

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1.目的片段/PCR产物送测序,用正反引物测。如果条带不带一,切目的条带送测;量不够,切胶后以此为模板再PCR,产物纯化后送测序。
2.载体送测序,尤其是多克隆位点的位置,不同测通。
3.目的条带与载体确认没毛病后,检查酶切位点,尽量使用有共用buff与酶切条件的常见酶进行双酶切,甚至可以考虑先加一个酶进行酶切,个把小时后再加入第二种酶进行酶切,效率更高。
4.考虑下用的酶有没有问题。
5.使用别的克隆方法,载体片段不大的话,考虑下gibson组装。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2019更好更棒!
2楼2018-12-06 22:15:15
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兮西熙

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by GRUBBY_WU at 2018-12-06 22:15:15
1.目的片段/PCR产物送测序,用正反引物测。如果条带不带一,切目的条带送测;量不够,切胶后以此为模板再PCR,产物纯化后送测序。
2.载体送测序,尤其是多克隆位点的位置,不同测通。
3.目的条带与载体确认没毛病 ...

不好意思哈,今天才看到。谢谢你的提议呀,我下次会按你说的方法改进一下

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3楼2018-12-08 23:41:53
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