| 查看: 704 | 回复: 2 | |||
[求助]
求一本书，专门介绍16s 测序极其结果处理 已有1人参与
|
|
求一本书，专门介绍16s 测序极其结果处理 要是有这样的书就好了 求大神帮助 |
回复此楼» 猜你喜欢
越来越担心硕士毕业后没有竞争力了
已经有16人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有6人回复
-
售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急
已经有6人回复
-
【长期招聘】复旦大学 AI 制药实验室 博士后招聘
已经有11人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急
已经有7人回复
-
2027博士申请-临床检验诊断学、病原生物学、微生物方向
已经有5人回复
-
各位基础老师们，看完中央《从严治党》的决定后，对学术界更加有信心了吧
已经有4人回复
-
申博自荐 2篇一区TOP+1篇EI+2公开发明专利 2027博士申请
已经有3人回复
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小冀-: 金币+2, 鼓励回帖 2018-11-16 12:35:15
秋天没有雨: 金币+5, ★有帮助 2018-11-30 09:12:29
感谢参与，应助指数 +1
小冀-: 金币+2, 鼓励回帖 2018-11-16 12:35:15
秋天没有雨: 金币+5, ★有帮助 2018-11-30 09:12:29
|
我们所说的16S 就是指 16S rDNA，所以，16S测序的大致逻辑就是： 拿到一个样品，我们捕获其16S区域（引物PCR），然后测序，16S既然有极好的保守性，那就可以用于鉴别不同的物种（相当于一个物种的独一无二的条形码）（有很大一部分是鉴定不到物种的）。 分析逻辑就是聚类成OTU，然后注释（比对已知数据库），后续分析。 Hiseq 的 16S分析流程已经比较成熟了，网上能搜到一些pipeline。 PacBio的 16S分析可参考文章：High-resolution phylogenetic microbial community profiling |
2楼2018-11-16 09:25:18
3楼2018-11-16 15:12:56