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求一本书，专门介绍16s 测序极其结果处理 已有1人参与
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求一本书，专门介绍16s 测序极其结果处理 要是有这样的书就好了 求大神帮助 |
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
小冀-: 金币+2, 鼓励回帖 2018-11-16 12:35:15
秋天没有雨: 金币+5, ★有帮助 2018-11-30 09:12:29
感谢参与，应助指数 +1
小冀-: 金币+2, 鼓励回帖 2018-11-16 12:35:15
秋天没有雨: 金币+5, ★有帮助 2018-11-30 09:12:29
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我们所说的16S 就是指 16S rDNA，所以，16S测序的大致逻辑就是： 拿到一个样品，我们捕获其16S区域（引物PCR），然后测序，16S既然有极好的保守性，那就可以用于鉴别不同的物种（相当于一个物种的独一无二的条形码）（有很大一部分是鉴定不到物种的）。 分析逻辑就是聚类成OTU，然后注释（比对已知数据库），后续分析。 Hiseq 的 16S分析流程已经比较成熟了，网上能搜到一些pipeline。 PacBio的 16S分析可参考文章：High-resolution phylogenetic microbial community profiling |
2楼2018-11-16 09:25:18