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liutaone

木虫 (正式写手)


[交流] 呼唤xi2004:cifcheck很多的警告,请问结构还要怎么精修

我这个晶体是通过固态反应得到的,晶体质量不好,收了几次了也都这样。请问目前怎么做能尽量减少警告,有的能解释下也行。现在文章在修改中,编辑能重新修下这个结构。
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......       0.78      
PLAT213_ALERT_2_A Atom N8      has ADP max/min Ratio .............       7.90 prola
PLAT213_ALERT_2_A Atom C12     has ADP max/min Ratio .............       8.60 prola
PLAT213_ALERT_2_A Atom C17     has ADP max/min Ratio .............       5.10 prola
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    N     Ueq(max)/Ueq(min) ...       6.33 Ratio
PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     253.00 A**3
--------------------------------------------------------------------------------Alert level B
REFLT03_ALERT_1_B  Reflection count < 90% complete (theta max?)
           From the CIF: _diffrn_reflns_theta_max           23.25
           From the CIF: _diffrn_reflns_theta_full          23.25
           From the CIF: _reflns_number_total               2432
           TEST2: Reflns within _diffrn_reflns_theta_max
           Count of symmetry unique reflns         2740
           Completeness (_total/calc)             88.76%
REFNR01_ALERT_3_B  Ratio of reflections to parameters is < 8 for a
            non-centrosymmetric structure, where ZMAX > 18
            sine(theta)/lambda                0.5554
            Proportion of unique data used    1.0000
            Ratio reflections to parameters   6.2359
THETM01_ALERT_3_B  The value of sine(theta_max)/wavelength is less than 0.575
            Calculated sin(theta_max)/wavelength =    0.5554
PLAT022_ALERT_3_B Ratio Unique / Expected Reflections too Low ....       0.89      
PLAT023_ALERT_3_B Resolution (too) Low [sin(theta)/Lambda < 0.6]..      23.25 Deg.
PLAT111_ALERT_2_B ADDSYM Detects (Pseudo) Centre of Symmetry .....         91 PerFi
PLAT201_ALERT_2_B Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) .......          9      
PLAT213_ALERT_2_B Atom N4      has ADP max/min Ratio .............       5.00 oblat
PLAT213_ALERT_2_B Atom N14     has ADP max/min Ratio .............       4.90 prola
PLAT241_ALERT_2_B Check High      Ueq as Compared to Neighbors for        Fe4     
PLAT341_ALERT_3_B Low Bond Precision on C-C Bonds (x 1000) Ang ...         27

[ Last edited by liutaone on 2009-4-23 at 09:33 ]
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liutaone

木虫 (正式写手)


数据下载地址见下面

[ Last edited by liutaone on 2009-4-23 at 02:06 ]
2楼2009-04-22 17:02:56
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liutaone

木虫 (正式写手)


3楼2009-04-22 17:17:38
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★
洛阳学子(金币+1,VIP+0):3Q 4-22 22:41
liutaone(金币+5,VIP+0): 4-22 23:52
发我邮箱看看,zhaoyangjingwei@gmail.com
4楼2009-04-22 18:40:15
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liutaone

木虫 (正式写手)


继续呼唤高手,呵呵,xi2004今天没来呀
5楼2009-04-22 22:37:30
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crystalsnet

新虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
liutaone(金币+5,VIP+0): 4-22 23:53
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......       0.78   


这是硬伤,我想很难有办法的
  
PLAT213_ALERT_2_A Atom N8      has ADP max/min Ratio .............       7.90 prola
PLAT213_ALERT_2_A Atom C12     has ADP max/min Ratio .............       8.60 prola
PLAT213_ALERT_2_A Atom C17     has ADP max/min Ratio .............       5.10 prola
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    N     Ueq(max)/Ueq(min) ...       6.33 Ratio

可能是潜在的无序或数据差造成的,可处理,但较麻烦

PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     253.00 A**3

这个不算太大的问题,解释一下还能通过
6楼2009-04-22 23:41:46
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liutaone

木虫 (正式写手)


嗯,这是一个set的数据,就是第一个连接的数据;所有set 的数据完全度能上去,就是第二个连接的数据,但是R因子很难修下来,不知道是什么原因,各向异性的时候原子会非正定,所以很难修下来,呼唤高手解决,金币什么的都好说,非常感谢。
7楼2009-04-22 23:59:05
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crystalsnet

新虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
liutaone(金币+15,VIP+0):非常感谢 4-24 10:29
向xi2004求助吧!
8楼2009-04-23 09:11:44
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liutaone

木虫 (正式写手)


放弃求助了,请版主把剩下的金币转给我,多谢。
9楼2009-04-23 22:50:51
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
洛阳学子(金币+1,VIP+0):谢谢你对晶体版的支持 4-24 00:25
liutaone(金币+15,VIP+0):非常感谢 4-25 17:42
好,我看看.
xi2004-emuch@163.com
10楼2009-04-23 23:08:43
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