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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 呼唤xi2004：cifcheck很多的警告，请问结构还要怎么精修
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liutaone

木虫 (正式写手)
呵呵，现在才来呀，
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11楼2009-04-23 23:17:00
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caty

至尊木虫 (著名写手)

小木虫潜水俱乐部名誉主席
★ ★ ★ ★ ★ ★
liutaone(金币+5,VIP+0):学习了，呵呵 4-24 00:00
洛阳学子(金币+1,VIP+0):谢谢交流 4-24 00:25
数据非常不好，强行精修晶体学上的意义不大。建议重新收，收满四个半球的数据
另外，cif中可见flack参数为0，无偏差值。如果精修是没有使用twin，flack参数是多少？
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谋事在人，成事在天
12楼2009-04-23 23:47:16
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liutaone

木虫 (正式写手)
这个重新收基本也就这样，因为是固态的单晶到单晶的反应，mosaicity比较高，积分的时候删掉的点比较多，所以数据不会很好。已经收了几次了，都是这样。晶体很小了，用的是转靶共聚焦的仪器。
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13楼2009-04-23 23:59:55
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liutaone

木虫 (正式写手)
原来是flack参数是0.09
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14楼2009-04-24 00:00:38
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caty

至尊木虫 (著名写手)

小木虫潜水俱乐部名誉主席
★ ★ ★ ★ ★
liutaone(金币+5,VIP+0):非常感谢 4-25 09:01
个人认为数据质量差，使结构看似无序，导致这些错误的产生。
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......       0.78      
PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     253.00 A**3
给出解释可以应付；
PLAT213_ALERT_2_A Atom N8      has ADP max/min Ratio .............       7.90 prola
PLAT213_ALERT_2_A Atom C12     has ADP max/min Ratio .............       8.60 prola
PLAT213_ALERT_2_A Atom C17     has ADP max/min Ratio .............       5.10 prola
PLAT220_ALERT_2_A Large Non-Solvent    N     Ueq(max)/Ueq(min) ...       6.33 Ratio
可以尝试限制性精修；
REFLT03_ALERT_1_B  Reflection count < 90% complete (theta max?)
           From the CIF: _diffrn_reflns_theta_max           23.25
           From the CIF: _diffrn_reflns_theta_full          23.25
           From the CIF: _reflns_number_total               2432
           TEST2: Reflns within _diffrn_reflns_theta_max
           Count of symmetry unique reflns         2740
           Completeness (_total/calc)             88.76%
REFNR01_ALERT_3_B  Ratio of reflections to parameters is < 8 for a
            non-centrosymmetric structure, where ZMAX > 18
            sine(theta)/lambda                0.5554
            Proportion of unique data used    1.0000
            Ratio reflections to parameters   6.2359
THETM01_ALERT_3_B  The value of sine(theta_max)/wavelength is less than 0.575
            Calculated sin(theta_max)/wavelength =    0.5554
PLAT022_ALERT_3_B Ratio Unique / Expected Reflections too Low ....       0.89      
这几个是硬伤；
建议LZ谨慎挑选投稿刊物
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谋事在人，成事在天
15楼2009-04-24 23:23:20
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