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竣竣

新虫 (初入文坛)

[求助] 提的植物DNA跑胶结果如图,求大神提点 已有2人参与

本人在分子生物学方面是新手,很多东西不太懂。

用植物叶片提的DNA
跑胶用的1%琼脂糖,70V,90min,EB染色,DNA标准化到100ng/uL,上样取得1uL,加的TEbuffer
提出效果如图。
求大神提点,是DNA提的问题,还是跑胶的问题??

实在传不了图片 只能上传百度网盘链接了,麻烦各位了~

https://pan.baidu.com/s/1NSNSHMZqB2zCaFssOUeCSg
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elmanbio

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+4, 鼓励回帖交流 2018-10-29 09:00:11
竣竣: 金币+40, ★★★★★最佳答案 2018-11-07 04:18:11
上图的时候可以说的更清楚一点
1 你是用试剂盒提取还是自己配置试剂提取?
如果试剂盒,只能说明这个盒子不太适合你的样本或者本身盒子研发的有问题,如果是你自己配置的试剂,那问题就多的很了,具体你也没有说清楚,也不好评论。
2 植物样本是什么样本?
不同植物样本差异其实还是比较大的,例如多糖多酚类的植物相对其他植物就比较有难度
3 看条带亮度
可以看出条带基本上不怎么亮,可以说明植物基因组提取效率基本上偏低
4 小分子带
小于100bp的带,可能是RNA的污染,可以考虑一下RNA酶
其他还有什么问他的话,可以站内联系

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2018-10-29 08:44:54
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竣竣

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by elmanbio at 2018-10-29 08:44:54
上图的时候可以说的更清楚一点
1 你是用试剂盒提取还是自己配置试剂提取?
如果试剂盒,只能说明这个盒子不太适合你的样本或者本身盒子研发的有问题,如果是你自己配置的试剂,那问题就多的很了,具体你也没有说清 ...

您好!感谢那你的认真回复。
我是用试剂盒提的,组里曾经用同样的试剂盒提过相同的植物叶片,效率是可以的,也加了DNase,那是不是我个人实验操作的问题?
我会尽快再试另外一组
感谢回复!
3楼2018-10-29 09:07:01
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elmanbio

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 竣竣 at 2018-10-29 09:07:01
您好!感谢那你的认真回复。
我是用试剂盒提的,组里曾经用同样的试剂盒提过相同的植物叶片,效率是可以的,也加了DNase,那是不是我个人实验操作的问题?
我会尽快再试另外一组
感谢回复!...

1 你可以做个平行对照,看看到底是盒子的问题还是样本的问题
2一般来说实验操作基本上没有问题
3试剂盒的话有柱子没有装好或者膜本身有问题,这个情况也是比较常见的
具体问题你可以具体对照一下
4楼2018-10-29 09:34:31
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781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
竣竣: 金币+10, ★★★很有帮助 2018-11-07 04:18:51
引用回帖:
3楼: Originally posted by 竣竣 at 2018-10-29 09:07:01
您好!感谢那你的认真回复。
我是用试剂盒提的,组里曾经用同样的试剂盒提过相同的植物叶片,效率是可以的,也加了DNase,那是不是我个人实验操作的问题?
我会尽快再试另外一组
感谢回复!...

不是提取的DNA吗?加了DNase干什么
采菊东篱下,悠然见南山。
5楼2018-10-29 11:13:00
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竣竣

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 781055707 at 2018-10-29 11:13:00
不是提取的DNA吗?加了DNase干什么...

不好意思 写错了 是RNase
6楼2018-11-07 04:18:44
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抚指依觞

新虫 (著名写手)

maker条带清晰,没有拖尾就可以基本排除跑胶的原因。问题应该是DNA降解太严重了,样品量按照试剂盒说明书来,选择幼嫩材料。操作要快并且要保证在加裂解液前是低温。

发自小木虫Android客户端
7楼2019-02-07 08:42:07
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