应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 拿到DNA测序结果后怎么办？
131/2返回列表12下一页
查看: 1606  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

shinyjoy

铜虫 (小有名气)

[交流] 拿到DNA测序结果后怎么办？

最近再做菌群结构鉴定的实验
终于拿到了DNA测序结果，但下一步怎么对照是什么菌属的呢？

谢谢~~~~~~~~
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2009-04-10 11:58:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xutao

金虫 (著名写手)

第三军团总参谋
不懂，顶一下，学习中
回复此楼
第三军团
2楼2009-04-10 12:14:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuyinghao

铁杆木虫 (职业作家)
★ ★
shinyjoy(金币+2,VIP+0):对我这个菜鸟来说，答案再详细点更好，请详细解释下，送剩余金币，呵呵 4-10 14:30
ncbi上blast啊！
回复此楼
3楼2009-04-10 12:25:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shinyjoy

铜虫 (小有名气)
可不可以详细点啊？
引用回帖:
Originally posted by chuyinghao at 2009-4-10 12:25:
ncbi上blast啊！

赞一下 回复此楼
4楼2009-04-10 14:28:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小猫三两只

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
shinyjoy(金币+3,VIP+0):谢谢 4-10 15:28
在百度上搜索NCBI,打开网页后,主页上有一个BLAST(比对),点击nucleotide blast
进入后将你的序列粘过去,直接分析就行了,可能会出现很多物种,找细菌的就行了
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2009-04-10 14:54:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

caroline1231

学习中 顶一下！
回复此楼
6楼2009-04-10 15:00:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunjq81

银虫 (小有名气)
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 点nucleotide blast 链接。输入序列后在database选择others。
然后开始比对，比对出来结果之后，然后根据出现的结果进行分析，如果均为同一个属，那就毫无疑问应该是该属，如果同时出现几个属，如果序列同源性相差比较大，取同源性高者，若相差不大就应该下载相应属的模式菌株序列(或可靠序列)构建发育树确定菌株的分类地位。
注意一般16S序列只能将菌株鉴定到属
赞一下 回复此楼
7楼2009-04-10 18:44:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

欣晴5832

金虫 (小有名气)
建议你用一个软件分析一下，比如DNASTAR，这个比较简单，打开序列后可以点击net search，直接登陆NCBI查找同源序列，将一致度高的序列全部列出，比较方便，可以试一下
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2009-04-10 19:29:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shinyjoy

铜虫 (小有名气)
谢谢指教，不过金币被我提前发完了，囧
请回答我新的问题吧，也有金币，呵呵
同谢欣桐~~
引用回帖:
Originally posted by sunjq81 at 2009-4-10 18:44:
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 点nucleotide blast 链接。输入序列后在database选择others。
然后开始比对，比对出来结果之后，然后根据出现的结果进行分析，如果均为同一个属，那就毫无疑 ...

赞一下 回复此楼
9楼2009-04-17 00:58:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gastrodia

金虫 (正式写手)
拿到测序结果应该先把你序列中载体的序列去除，然后再去NCBIblast，
赞一下 回复此楼
10楼2009-04-17 11:48:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 shinyjoy 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料调剂 5+3 想要一壶桃花水 2026-03-25 7/350 2026-03-26 03:29 by sjeidudkso
[考研] 289求调剂 +15 硕星赴 2026-03-23 15/750 2026-03-26 02:16 by BruceLiu320
[考研] 一志愿哈工大，085400，320，求调剂 +4 gdlf9999 2026-03-24 4/200 2026-03-25 23:01 by boxking200
[考研] 材料与化工328分调剂 +6 。，。，。，。i 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:30 by 418490947
[考研] 化学调剂一志愿上海交通大学336分-本科上海211 +3 小鱼爱有机 2026-03-25 3/150 2026-03-25 20:13 by qingfeng258
[考研] 材料与化工 322求调剂 +6 然11 2026-03-19 6/300 2026-03-25 18:37 by haxia
[考研] 网络空间安全0839招调剂 +4 w320357296 2026-03-25 6/300 2026-03-25 17:59 by 255671
[考研] 材料学硕333求调剂 +4 北道巷 2026-03-24 4/200 2026-03-25 14:16 by mapenggao
[考研] 285求调剂 +3 AZMK 2026-03-24 3/150 2026-03-25 12:23 by userper
[考研] 286求调剂 +11 Faune 2026-03-21 11/550 2026-03-25 10:11 by 雾散后相遇lc
[考研] 一志愿武理085500机械专业总分300求调剂 +3 an10101 2026-03-24 7/350 2026-03-25 00:00 by 山鬼0-
[考研] 307求调剂 +5 超级伊昂大王 2026-03-24 5/250 2026-03-24 15:46 by 星空星月
[基金申请] 请教下大家 2026年国家基金申请是双盲审吗？ +3 lishucheng1 2026-03-22 5/250 2026-03-24 08:22 by gltch
[考研] 327求调剂 +5 prayer13 2026-03-23 5/250 2026-03-23 22:11 by 星空星月
[考研] 276求调剂 +3 YNRYG 2026-03-21 4/200 2026-03-23 08:31 by 醉在风里
[考研] 一志愿东华大学化学070300，求调剂 +7 2117205181 2026-03-21 8/400 2026-03-22 22:55 by chixmc
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 石河子大学（211、双一流）硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 初试 317 +7 半拉月丙 2026-03-20 7/350 2026-03-21 22:26 by peike
[考研] A区线材料学调剂 +5 周周无极 2026-03-20 5/250 2026-03-20 21:33 by laoshidan
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭