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拿到DNA测序结果后怎么办？
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最近再做菌群结构鉴定的实验 终于拿到了DNA测序结果，但下一步怎么对照是什么菌属的呢？ 谢谢~~~~~~~~ |
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售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急
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2027广东省杰青
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5楼2009-04-10 14:54:26
xutao
金虫 (著名写手)
第三军团总参谋
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 1110.9
- 散金: 14
- 帖子: 1967
- 在线: 94.4小时
- 虫号: 734276
- 注册: 2009-03-29
- 性别: GG
- 专业: 生殖系统/围生医学/新生儿
2楼2009-04-10 12:14:53
4楼2009-04-10 14:28:26
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http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 点nucleotide blast 链接。输入序列后在database选择others。 然后开始比对，比对出来结果之后，然后根据出现的结果进行分析，如果均为同一个属，那就毫无疑问应该是该属，如果同时出现几个属，如果序列同源性相差比较大，取同源性高者，若相差不大就应该下载相应属的模式菌株序列(或可靠序列)构建发育树确定菌株的分类地位。 注意一般16S序列只能将菌株鉴定到属 |
7楼2009-04-10 18:44:04
