24小时热门版块排行榜    

查看: 1614  |  回复: 12
当前主题已经存档。
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

shinyjoy

铜虫 (小有名气)

[交流] 拿到DNA测序结果后怎么办?

最近再做菌群结构鉴定的实验
终于拿到了DNA测序结果,但下一步怎么对照是什么菌属的呢?

谢谢~~~~~~~~
回复此楼

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小猫三两只

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
shinyjoy(金币+3,VIP+0):谢谢 4-10 15:28
在百度上搜索NCBI,打开网页后,主页上有一个BLAST(比对),点击nucleotide blast
进入后将你的序列粘过去,直接分析就行了,可能会出现很多物种,找细菌的就行了
5楼2009-04-10 14:54:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

xutao

金虫 (著名写手)

第三军团总参谋

不懂,顶一下,学习中
第三军团
2楼2009-04-10 12:14:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

shinyjoy

铜虫 (小有名气)

可不可以详细点啊?
引用回帖:
Originally posted by chuyinghao at 2009-4-10 12:25:
ncbi上blast啊!

4楼2009-04-10 14:28:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sunjq81

银虫 (小有名气)

http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi 点nucleotide blast 链接。输入序列后在database选择others。
然后开始比对,比对出来结果之后,然后根据出现的结果进行分析,如果均为同一个属,那就毫无疑问应该是该属,如果同时出现几个属,如果序列同源性相差比较大,取同源性高者,若相差不大就应该下载相应属的模式菌株序列(或可靠序列)构建发育树确定菌株的分类地位。
注意一般16S序列只能将菌株鉴定到属
7楼2009-04-10 18:44:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 274求调剂 +10 顾九笙要谦虚 2026-03-24 14/700 2026-03-26 01:09 by 15366876211
[考研] 一志愿 西北大学 总分282 英语一62 求调剂 +3 18419759900 2026-03-25 3/150 2026-03-25 23:20 by peike
[考研] 334分 一志愿武理-080500 材料求调剂 +4 李李不服输 2026-03-25 4/200 2026-03-25 21:26 by 星空星月
[考研] 085602 289分求调剂 +7 WWW西西弗斯 2026-03-24 7/350 2026-03-25 14:28 by 3Strings
[考研] 求调剂 +3 李李不服输 2026-03-25 3/150 2026-03-25 13:03 by cmz0325
[考研] 081700 调剂 267分 +10 迷人的哈哈 2026-03-23 10/500 2026-03-25 12:12 by userper
[考研] 一志愿吉林大学材料与化工303分求调剂 +4 为学666 2026-03-24 4/200 2026-03-25 11:27 by BruceLiu320
[考研] 287求调剂 +10 晨昏线与星海 2026-03-19 11/550 2026-03-25 10:35 by userper
[考研] 318求调剂 +5 plum李子 2026-03-21 8/400 2026-03-25 09:26 by aa331100
[考研] 材料专硕找调剂 +5 哈哈哈吼吼吼哈 2026-03-23 5/250 2026-03-24 19:07 by 了了了了。。
[考研] 300求调剂,材料科学英一数二 +5 leaflight 2026-03-24 5/250 2026-03-24 16:25 by laoshidan
[考研] 291求调剂 +8 hhhhxn.. 2026-03-23 8/400 2026-03-23 23:15 by peike
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境,总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-23 8/400 2026-03-23 20:36 by Creta
[考研] 化学308分求调剂 +3 你好明天你好 2026-03-23 3/150 2026-03-23 20:11 by macy2011
[考研] 291求调剂 +5 孅華 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:20 by haoshis
[考研] 一志愿东华大学控制学硕320求调剂 +3 Grand777 2026-03-21 3/150 2026-03-21 19:23 by 简之-
[考研] 279求调剂 +5 红衣隐官 2026-03-21 5/250 2026-03-21 14:59 by lature00
[考研] 一志愿 西北大学 ,070300化学学硕,总分287,双非一本,求调剂。 +4 晨昏线与星海 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:15 by JourneyLucky
[考研] 一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +5 @taotao 2026-03-20 5/250 2026-03-20 20:16 by JourneyLucky
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
信息提示
请填处理意见